典型文献
基于转录组测序的茄子萼下果色光敏相关基因表达分析
文献摘要：
为了探究茄子光敏品种和非光敏品种控制萼下果色的差异基因,以萼下紫色的圆茄自交系Y5和萼下绿色的圆茄自交系Y73萼片下果皮为试材,进行去萼片见光0、4和8 h的转录组测序.共获得75.61Gb有效数据(Clean data),Q30碱基百分比均达到93.97％以上;两个自交系材料在3个时间点的转录组测序比较共获得11 812个差异表达基因,包括5 277个上调基因和6 535个下调基因.3个时间点数据KEGG富集分析同时指向苯丙烷生物合成、类黄酮生物合成和光合生物的固碳作用通路.苯丙烷和类黄酮生物合成路径中共同差异表达的基因有4个,分别是FAOMT、CCOAOMT、CYP73A4和HST.筛选出了与花青素合成相关结构基因CHI、ANS、F3H、PAL以及转录因子基因MYB113在萼下果皮表达差异显著.
文献关键词：
茄子;转录组测序;萼下果色;光敏;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
乔军;王利英;刘婧;李素文
作者机构：
天津科润农业科技股份有限公司蔬菜研究所,天津300381;蔬菜种质创新国家重点实验室,天津市蔬菜遗传育种企业重点实验室,天津300381;天津市农业科学院蔬菜研究所,天津300381
文献出处：
引用格式：
[1]乔军;王利英;刘婧;李素文-.基于转录组测序的茄子萼下果色光敏相关基因表达分析)[J].园艺学报,2022(11):2347-2356
A类：
萼下果色,Y73,61Gb,FAOMT,CCOAOMT,CYP73A4,MYB113
B类：
转录组测序,茄子,色光,光敏,相关基因表达,基因表达分析,差异基因,紫色,自交系,Y5,萼片,果皮,共获,有效数据,Clean,data,Q30,碱基,差异表达基因,富集分析,苯丙烷,生物合成,类黄酮,光合,固碳作用,作用通路,合成路径,HST,花青素合成,结构基因,CHI,ANS,F3H,PAL,表达差异
AB值：
0.34324
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