典型文献
大豆PP2C家族基因鉴定与响应盐胁迫的转录组分析
文献摘要：
植物蛋白磷酸酶2C(PP2C)能够通过影响植物体内多种生物学过程在环境胁迫响应中发挥重要作用.为研究栽培大豆PP2C家族成员在盐胁迫中的功能,通过生物信息学手段结合转录组学分析对栽培大豆PP2C家族进行了系统探究.在栽培大豆中共鉴定出126个PP2C家族成员,并将其在进化树上分为11个亚家族,同一亚家族的成员具有类似的基因和蛋白结构.盐胁迫转录组测序结果显示,大豆126个GmPP2 C基因中有9个是差异表达基因,其中,GmPP2C41、GmPP2C48、GmPP2C72、GmPP2C84、GmPP2C89、GmPP2C107和GmPP2C113在盐处理后表达水平上调,GmPP2C27和GmPP2C114在盐处理后表达下调.qRT-PCR结果显示,GmPP2C89和GmPP2C113在盐处理6 h表达水平上调最高.GO富集分析发现,9个差异基因主要具有离子结合和磷酸酶活性;Y2H结果显示,GmPP2C113和GmPP2C47能够互作.以上结果将为进一步研究大豆PP2C家族成员在盐胁迫响应中的功能与分子机制提供理论依据,为大豆耐盐性遗传改良提供重要候选基因.
文献关键词：
大豆;蛋白磷酸酶;盐胁迫;转录组;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
杨昕霞;唐满生;张斌
作者机构：
湖南科技学院后勤处,湖南 永州 425199;湖南科技学院化学与生物工程学院,湖南 永州 425199
文献出处：
引用格式：
[1]杨昕霞;唐满生;张斌-.大豆PP2C家族基因鉴定与响应盐胁迫的转录组分析)[J].浙江农业学报,2022(02):207-220
A类：
GmPP2,GmPP2C41,GmPP2C48,GmPP2C72,GmPP2C84,GmPP2C89,GmPP2C107,GmPP2C113,GmPP2C27,GmPP2C114,GmPP2C47
B类：
家族基因,基因鉴定,盐胁迫,转录组分析,植物蛋白,蛋白磷酸酶,植物体,生物学过程,环境胁迫,胁迫响应,栽培大豆,转录组学分析,系统探究,进化树,树上,亚家族,蛋白结构,转录组测序,差异表达基因,盐处理,qRT,富集分析,差异基因,离子结合,磷酸酶活性,Y2H,耐盐性,遗传改良,重要候选基因
AB值：
0.222911
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