典型文献
谷子ABC1基因家族全基因组鉴定及表达分析
文献摘要：
[目的]ABC1(activity of bc1 complex)是存在于原核及真核生物中的一类蛋白质激酶家族,在植物响应逆境胁迫中发挥重要作用.[方法]为了解谷子基因组中ABC1基因家族的特征及潜在功能,使用HMMER软件对xiaomi基因组中的ABC1家族成员进行鉴定,利用TBtools、MEGA等对谷子ABC1家族基因的染色体分布、基因及蛋白结构、启动子顺式作用元件及亚细胞定位等进行预测,并分析了ABC1家族基因的组织特异性表达模式及响应禾生指梗霉侵染的表达特征.[结果]在xiaomi基因组中共鉴定到谷子ABC1家族基因26个,分布于谷子9条染色体上,编码氨基酸在282～942 aa;系统发育分析表明,谷子ABC1家族成员分为6类,具有8个motif基序,其中motif2和motif3为谷子ABC1家族基因最保守的两段基序;顺式作用元件分析表明,与光响应和激素响应的作用元件最多,不同家族基因在种子、根、茎、叶和穗之间存在组织特异性表达,12个基因在受到禾生指梗霉侵染时表达下调.[结论]在xiaomi基因组中鉴定出同时含有保守域的26个ABC1家族基因,均具有与光响应和脱落酸相关的作用元件,其中定位于叶绿体的SiABC1-5与SiABC1-12基因可能在谷子光合作用中发挥重要作用.
文献关键词：
谷子;ABC1基因家族;系统进化;叶绿体定位;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
张诺;任志贤;徐林;刘旭;张宝俊
作者机构：
山西农业大学 植物保护学院,山西 太谷 030801
文献出处：
引用格式：
[1]张诺;任志贤;徐林;刘旭;张宝俊-.谷子ABC1基因家族全基因组鉴定及表达分析)[J].江西农业大学学报,2022(05):1075-1082
A类：
ABC1,bc1,xiaomi,禾生指梗霉,SiABC1
B类：
谷子,基因家族,全基因组鉴定,表达分析,activity,complex,原核,真核生物,类蛋白质,逆境胁迫,HMMER,TBtools,MEGA,家族基因,蛋白结构,启动子,顺式作用元件,亚细胞定位,组织特异性,特异性表达,表达模式,侵染,表达特征,aa,系统发育分析,基序,motif2,motif3,两段,光响应,激素响应,脱落酸,光合作用,系统进化,叶绿体定位
AB值：
0.261056
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