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菠萝R2R3-MYB基因家族S20亚族的鉴定
文献摘要：
[目的]鉴定菠萝R2R3-MYB基因家族S20亚族成员,分析其进化、结构与表达模式,为菠萝S20亚族的生物学功能研究奠定基础.[方法]以菠萝基因组数据库为基础,利用生物信息学方法对菠萝S20亚族基因进行鉴定,并对其系统进化、结构、保守基序和表达模式进行系统分析.同时,克隆并原核表达代表性基因AcMYB108a,利用Western blot进行杂交验证.[结果]在菠萝基因组上共鉴定到5个S20亚族基因,分布于5条染色体上.系统进化与保守基序分析发现,不同植物的S20蛋白具有较高的保守性且均具有motif3保守基序.顺式作用元件分析表明,菠萝S20亚族基因与植物逆境胁迫响应过程有关,且受乙烯诱导.基因表达分析结果显示,S20亚族基因的表达存在组织特异性,其中AcMYB108a在果实中的表达水平最高.利用pET原核表达系统成功表达了 AcMYB108a重组蛋白,并通过了 Western杂交验证.[结论]菠萝S20亚族基因与逆境胁迫响应相关,且受到乙烯诱导.
文献关键词：
菠萝;MYB基因;S20亚族基因;原核表达;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
贺涵;刘传和;邵雪花;赖多;匡石滋;肖维强
作者机构：
广东省农业科学院果树研究所,农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室,广东省热带亚热带果树研究重点实验室,广东广州510640
文献出处：
引用格式：
[1]贺涵;刘传和;邵雪花;赖多;匡石滋;肖维强-.菠萝R2R3-MYB基因家族S20亚族的鉴定)[J].西北农林科技大学学报（自然科学版）,2022(12):117-127
A类：
AcMYB108a
B类：
菠萝,R2R3,基因家族,S20,表达模式,生物学功能,功能研究,基因组数据,利用生物,生物信息学方法,系统进化,保守基序,原核表达,blot,交验,不同植物,保守性,motif3,顺式作用元件,逆境胁迫响应,响应过程,乙烯诱导,基因表达分析,组织特异性,pET,表达系统,重组蛋白
AB值：
0.250715
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