典型文献
猪流行性腹泻病毒山东SD20BZ01株的分离鉴定及遗传进化分析
文献摘要：
为了解山东省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)基因组遗传演化特征,将山东省滨州市某猪场的PEDV阳性样品接种Vero E6细胞,结果成功分离到1株PEDV,将其命名为SD20BZ01株.通过RT-PCR分段扩增病毒基因组,经测序、拼接获得SD20BZ01株全基因组序列,并将其与GenBank收录的参考毒株序列进行同源性比对和遗传进化分析.全基因组序列分析结果显示,SD20BZ01株与我国2010年以来流行的GII-b亚群变异株序列同源性为97.8％～98.7％,明显高于CV777、DR13、SM98、SD-M等早期经典毒株,因此SD20BZ01属于GII-b亚群变异株.基于S基因的遗传进化关系与基于全基因组序列的遗传进化关系基本一致.与CV777株相比,SD20BZ01株S蛋白在中和抗原表位COE处有10个氨基酸突变,与近年来变异株S蛋白的氨基酸序列基本一致,说明GII-b亚群PEDV的变异规律逐渐趋于稳定.本研究为山东省PEDV流行病学研究及其流行控制策略的制定提供了理论依据.
文献关键词：
猪流行性腹泻病毒;病毒分离;全基因序列;遗传进化分析
中图分类号：
作者姓名：
田似报;尹明荣;王文文;厉磊;王一新;李阳
作者机构：
北京中科基因技术股份有限公司,北京 102600;山东农业大学动物科技学院,山东泰安 271018;临沂市畜牧发展促进中心,山东临沂 276003;中国动物卫生与流行病学中心,山东青岛 266032
文献出处：
引用格式：
[1]田似报;尹明荣;王文文;厉磊;王一新;李阳-.猪流行性腹泻病毒山东SD20BZ01株的分离鉴定及遗传进化分析)[J].中国动物检疫,2022(06):24-29
A类：
SD20BZ01,SM98
B类：
猪流行性腹泻病毒,分离鉴定,遗传进化分析,porcine,epidemic,diarrhea,virus,PEDV,遗传演化,演化特征,山东省滨州市,猪场,Vero,E6,功分,病毒基因组,拼接,接获,GenBank,毒株,行同,全基因组序列分析,来流,GII,亚群,变异株,序列同源性,CV777,DR13,进化关系,中和抗原表位,COE,氨基酸突变,来变,氨基酸序列,变异规律,流行病学研究,病毒分离,全基因序列
AB值：
0.261338
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