典型文献
红麻亚硝酸还原酶基因HcNiR的克隆与表达分析
文献摘要：
[目的] 了解红麻亚硝酸还原酶基因HcNiR生物信息学特性及组织表达特异性,为培育红麻氮高效利用品种提供理论依据.[方法] 以红麻材料349叶片的cDNA为模板,利用PCR扩增HcNiR基因的CDS序列,采用生物信息学方法分析HcNiR的氨基酸组成、蛋白质跨膜结构、信号肽、高级结构以及蛋白的同源进化树;采用实时荧光定量PCR检测HcNiR基因在红麻不同组织的表达情况.[结果] HcNiR基因cDNA全长1395 bp,编码蛋白含有464个氨基酸,包含2个保守的亚硝酸和亚硫酸还原酶4Fe-4S结构域及铁氧蛋白部分结构域.HcNiR蛋白是一个不含跨膜转运结构与信号肽的亲水稳定性蛋白质,该蛋白质等电点是5.49,分子量51.68 kDa;具有26处潜在磷酸化位点.在其蛋白二级结构中,α-螺旋和无规则卷曲所占比例超过70％.通过氨基酸序列同源性分析发现,红麻HcNiR氨基酸序列与木槿HsNiR氨基酸序列相似性较高,达到97.37％,都含有铁-硫/铁血红素结合位点.进化树分析结果表明,红麻HcNiR基因与木槿HsNiR基因亲缘关系较近.组织特异性表达结果显示,红麻HcNiR基因在叶中的表达量高于根.[结论] HcNiR基因编码蛋白含亚硝酸和亚硫酸还原酶4Fe-4S结构域及铁氧蛋白部分结构域;HcNiR基因具有组织表达特异性,在红麻叶片中表达较高,推测其主要在初级氮的同化过程中发挥重要调控作用.
文献关键词：
红麻;亚硝酸还原酶;HcNiR基因;基因克隆;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
张超;邓勇;黄思齐;伍应保;张高阳;满百膺;李德芳
作者机构：
上饶师范学院生命科学学院,江西 上饶 334001;中国农业科学院麻类研究所,湖南 长沙 410205
文献出处：
引用格式：
[1]张超;邓勇;黄思齐;伍应保;张高阳;满百膺;李德芳-.红麻亚硝酸还原酶基因HcNiR的克隆与表达分析)[J].福建农业学报,2022(05):600-608
A类：
HcNiR,HsNiR
B类：
红麻,亚硝酸还原酶,酶基因,克隆与表达,表达分析,组织表达,达特,氮高效利用,cDNA,CDS,生物信息学方法,氨基酸组成,膜结构,信号肽,不同组织,全长,bp,编码蛋白,亚硫酸,4Fe,4S,结构域,跨膜转运,亲水,水稳定性,等电点,分子量,kDa,磷酸化,蛋白二级结构,无规则,卷曲,氨基酸序列,序列同源性,同源性分析,木槿,铁血,血红素,结合位点,进化树分析,亲缘关系,组织特异性,特异性表达,基因编码,有组织,基因克隆
AB值：
0.252637
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