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典型文献
滇水金凤LWD基因的克隆及表达分析
文献摘要:
WD40是转录因子大家族,具有调节花青素苷生物合成、植物生长发育及非生物胁迫响应等功能,LWD(LIGHT-REGULATED WD)基因是该家族中已知的生物钟调节因子,但目前有关植物LWD基因的报道较少,其功能还有待深入研究.为探究LWD基因对滇水金凤花色的影响,本研究以滇水金凤花器官为材料,采用RT-PCR等技术克隆得到2个滇水金凤LWD基因,分别命名为IuLWD1和IuLWD2,其cDNA全长分别为1041 bp和1032 bp,分别编码347个和344个氨基酸.基本理化性质分析显示,IuLWD1和IuLWD2的GC含量分别为46%和50%,相对分子量分别为38838.47 kDa和39029.65 kDa,理论等电点分别为4.71和4.70.IuLWD1和IuLWD2的不稳定指数分别为53.60和52.58,均属于不稳定蛋白;其总平均亲水指数分别为–0.388和–0.366,均为亲水性蛋白.结构域分析显示,IuLWD1和IuLWD2均含有6个典型的WD40-repeat保守结构域,属于WD40超家族.多序列比对发现,IuLWD1和IuLWD2氨基酸序列与牡丹、葡萄及杨梅等氨基酸序列相似度较高.系统发育分析表明,IuLWD1与葡萄和牡丹聚为一支,同源性达85%;IuLWD2与杨梅聚为一支,同源性达90%,然后共同聚类在一支,推测2个基因为旁系亲缘关系.qRT-PCR分析表明,IuLWD1和IuLWD2基因在4种不同花色滇水金凤及其4个不同发育阶段均有表达,均以深红色表达量最高,白色表达量最低,2个基因的表达量均与花色呈正相关,且IuLWD1基因的表达量高于IuLWD2基因的表达量,表明IuLWD1和IuLWD2基因均在滇水金凤花色素苷的生物合成中发挥了作用,且IuLWD1基因对滇水金凤花色形成的调控作用更强.该研究结果为进一步探究滇水金凤花色形成及变异机理、凤仙花花色改良及新品种培育奠定基础.
文献关键词:
滇水金凤;LWD基因;花色;表达分析
作者姓名:
李新艺;李洋;罗超;魏春梅;黄美娟;瞿素萍;黄海泉
作者机构:
西南林业大学园林园艺学院/国家林业和草原局西南风景园林工程技术研究中心/云南省功能性花卉资源及产业化技术工程研究中心/西南林业大学园林园艺花卉研发中心,云南昆明 650224;云南省农业科学院花卉研究所,云南昆明 650205
文献出处:
引用格式:
[1]李新艺;李洋;罗超;魏春梅;黄美娟;瞿素萍;黄海泉-.滇水金凤LWD基因的克隆及表达分析)[J].热带作物学报,2022(06):1152-1159
A类:
REGULATED,IuLWD1,IuLWD2
B类:
滇水金凤,表达分析,WD40,大家族,花青素苷生物合成,植物生长发育,非生物胁迫,胁迫响应,LIGHT,生物钟,调节因子,金凤花,花器官,cDNA,全长,bp,分别编,基本理化性质,性质分析,相对分子量,kDa,等电点,亲水性,repeat,保守结构域,超家族,多序列比对,氨基酸序列,牡丹,杨梅,系统发育分析,同源性,同聚,旁系亲,亲缘关系,qRT,同花,发育阶段,深红色,在滇,花色素苷,变异机理,凤仙花,花花,新品种培育
AB值:
0.233861
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