典型文献
蒙古栎QmMYC基因家族鉴定及其干旱胁迫下表达分析
文献摘要：
蒙古栎(Quercus mongolica Fisch.ex Ledeb.)是中国东北次生落叶阔叶林的主要建群树种之一,耐干旱耐贫瘠.植物MYC转录因子可以响应干旱胁迫.基于蒙古栎全基因组数据,利用生物信息学手段对QmMYC基因家族进行结构和功能预测,结果显示,QmMYCs有11个成员,命名为QmMYC1～11,分为4个组,其CDS长度和编码氨基酸长度分别介于1293～2139bp和430～712aa之间,分子量为48～79KDa,二级结构由α-螺旋、延伸链和无规则卷曲组成,均为不稳定亲水蛋白并被定位到细胞核上,且每个组内基因和蛋白结构较为相似.11个QmMYCs分别定位到蒙古栎的6条染色体上.QmMYCs启动子区域存在多个与蒙古栎激素调节和逆境等相关的顺式作用元件.qRT-PCR分析显示,除QmMYC11外,其余QmMYCs均受到10％PEG6000模拟干旱胁迫的显著影响:QmMYC5/8/9和QmMYC1/3/4/6/7分别是胁迫6h和12h的主要响应因子,其中QmMYC4响应最显著,12h后多数基因表达下调,而QmMYC2/10表达有一定滞后性,于24h表达最高.研究结果对于进一步认识QmMYC基因家族,阐明QmMYCs在蒙古栎抵御干旱胁迫时的生物学功能提供参考依据.
文献关键词：
蒙古栎;QmMYC基因家族;干旱胁迫;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
王天宠;艾万峰;刘汉嶂;刘琳;马素娟;陆秀君
作者机构：
沈阳农业大学林学院,沈阳110161
文献出处：
引用格式：
[1]王天宠;艾万峰;刘汉嶂;刘琳;马素娟;陆秀君-.蒙古栎QmMYC基因家族鉴定及其干旱胁迫下表达分析)[J].沈阳农业大学学报,2022(02):147-156
A类：
QmMYC,QmMYCs,QmMYC1,2139bp,712aa,79KDa,QmMYC11,QmMYC5,QmMYC4,QmMYC2
B类：
蒙古栎,基因家族鉴定,干旱胁迫,表达分析,Quercus,mongolica,Fisch,ex,Ledeb,中国东北,落叶阔叶林,建群树种,耐贫瘠,全基因组,基因组数据,利用生物,结构和功能,功能预测,CDS,别介,分子量,二级结构,无规则,卷曲,定亲,亲水,细胞核,蛋白结构,启动子区域,激素调节,逆境,顺式作用元件,qRT,PEG6000,6h,12h,滞后性,24h,生物学功能,表达模式
AB值：
0.277219
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