典型文献
肺鳞状细胞癌自噬相关基因预后风险评分模型构建及分析
文献摘要:
目的:探索构建基于自噬相关基因(ARGs)肺鳞状细胞癌(LUSC)预后风险评分模型并分析。方法:通过GeneCards数据库获得4 418个ARGs。从TCGA数据库收集了551例LUSC患者的基因表达谱及临床数据,提取所有ARGs的表达数据,利用R软件筛选差异表达的ARGs。对差异表达的ARGs进行富集分析。利用Cox回归模型构建ARGs的预后风险评分模型。根据风险评分计算公式计算出每个样本的风险评分,以中位数为cut-off值,将患者分为高风险评分组和低风险评分组。绘制多指标受试者工作特征曲线并计算风险评分评估模型性能。最后利用单因素和多因素Cox回归分析评价模型是否具有独立预后价值,并分析其临床相关性。利用外部数据集对其验证。结果:初步筛选了50个有预后价值的差异表达的ARGs,以此为基础,利用Cox回归分析构建了由5个ARGs(LAMP2、TUSC1、CDKN1A、ITGB1、RGS19)组成的LUSC预后风险评分模型。该模型中,低风险评分组与高风险评分组的生存时间比较差异有统计学意义(3.032年比2.275年,
t=3.23,
P<0.001)。风险评分在单因素和多因素Cox回归分析中与LUSC患者预后比较差异均有统计学意义(
P值均<0.001),提示风险评分可作为LUSC潜在的独立预后因素。并且,与外部数据集交叉验证仍有良好预测效果。临床特征相关性分析表明高风险评分与年龄、性别和发生不良预后密切相关。
结论:构建了一个由5个ARGs组成的LUSC风险评分模型,该模型可为预测LUSC患者预后提供参考,未来或可与恶性肿瘤分期联合应用于LUSC患者的预后预测。
文献关键词:
肺肿瘤;自噬;预后;Cox回归模型
中图分类号:
作者姓名:
王展展;陈秋羽;夏铀铀;李春华
作者机构:
南京医科大学连云港临床医学院,连云港 222002
文献出处:
引用格式:
[1]王展展;陈秋羽;夏铀铀;李春华-.肺鳞状细胞癌自噬相关基因预后风险评分模型构建及分析)[J].国际呼吸杂志,2022(13):1003-1012
A类:
TUSC1,RGS19
B类:
肺鳞状细胞癌,自噬相关基因,预后风险评分模型,探索构建,ARGs,LUSC,GeneCards,TCGA,基因表达谱,临床数据,差异表达,富集分析,Cox,公式计算,中位数,cut,off,低风险,多指标,受试者工作特征曲线,计算风险,模型性能,预后价值,临床相关性,外部数据,初步筛选,LAMP2,CDKN1A,ITGB1,生存时间,独立预后因素,交叉验证,不良预后,肿瘤分期,联合应用,预后预测,肺肿瘤
AB值:
0.222149
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