典型文献
基于公共数据库分析自噬相关基因在肺腺癌患者中的预后意义
文献摘要：
目的 利用生物信息学技术对自噬相关基因(ATGs)进行分析,并建立预测肺腺癌患者预后的基因表达模型.方法 利用TCGA数据库筛选肿瘤组织和正常组织中差异表达的ATGs,进行GO和KEGG富集分析确定与ATGs相关的信号通路,再进行单变量和多变量Cox回归分析确定与生存率相关的ATGs,最后根据中位风险评分进行生存分析,评价风险评分的预后价值.结果 共筛选出200个ATGs在肺腺癌中差异表达.30个ATGs被筛选出作为与预后相关的基因.GO和KEGG富集分析均显示,ATGs与自噬相关信号通路有关.单因素Cox回归分析显示,从肺腺癌TCGA数据库中获得了21个预后相关ATGs,其中9个ATGs(ATG4A、NLRC4、PRKCD、DAPK2、SIRT2、CCR2、ATG16L2、DLC1、DRAM1)被认为是保护性基因(HR<1),其余12个ATGs(ITGB4、BIRC5、CTSL、SPHK1、APOL1、ITGA6、ITGB1、GAPDH、ERO1A、EIF2S1、MBTPS2、ST13)被认为是危险性基因(HR>1).多因素Cox回归分析显示,低风险组和高风险组中包含的8个ATGs(ATG4A、CCR2、MBTPS2、APOL1、ERO1A、SPHK1、ST13和ITGA6)的表达差异,而高危组患者倾向于表达危险基因,而低危组患者倾向于表达保护基因.风险评分是肺腺癌TCGA的独立预后指标(P<0.05),风险评分(AUC=0.763)具有更好的预测性能.结论 本研究构建了一个基于8个ATGs的预后特征模型,为肺腺癌患者的预后评估提供了方向,并为治疗方案提供了潜在研究靶点.
文献关键词：
肺腺癌;自噬相关基因;预后模型;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
李敖;王玉然;王文浩
作者机构：
潍坊医学院附属医院肿瘤科,山东 潍坊 261041;潍坊医学院附属医院放疗科,山东 潍坊 261041
文献出处：
引用格式：
[1]李敖;王玉然;王文浩-.基于公共数据库分析自噬相关基因在肺腺癌患者中的预后意义)[J].医学信息,2022(22):17-22
A类：
ATG4A,DAPK2,ATG16L2,DLC1,DRAM1,APOL1,EIF2S1
B类：
公共数据库,数据库分析,自噬相关基因,肺腺癌患者,预后意义,利用生物,生物信息学技术,ATGs,表达模型,TCGA,肿瘤组织,正常组织,差异表达,富集分析,多变量,Cox,率相关,风险评分,生存分析,预后价值,NLRC4,PRKCD,SIRT2,CCR2,ITGB4,BIRC5,CTSL,SPHK1,ITGA6,ITGB1,GAPDH,ERO1A,MBTPS2,ST13,低风险组,高风险组,表达差异,保护基因,预后指标,预测性能,研究构建,特征模型,预后评估,预后模型
AB值：
0.313956
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