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典型文献
基于多数据库筛选胃癌的自噬相关基因及预后预测模型的建立
文献摘要:
目的 通过多种癌症基因数据库构建胃癌自噬相关基因(ARGs)预后预测模型.方法 从人类自噬数据库和GSEA分子特征数据库获得自噬基因,与GEO数据库得到的胃癌差异表达基因进行比对,从而筛选出胃癌ARGs.对胃癌ARGs进行富集分析及通路分析、多因素COX回归分析,筛选关键ARGs,应用R语言进行生存曲线分析、构建列线图及预测模型并对模型进行检验.结果 从多种数据库下载得到胃癌差异表达基因和自噬基因,从中筛选出102个重合基因即胃癌ARGs,Lasso回归和COX多因素分析筛选最终得到2个关键ARGs,即DYNC1I1、RNASE1.基于两个基因建立1、3、5年生存期预测模型和诺莫列线图校正曲线,C值为0.68,提示该模型有相对较好的预测能力.结论 本研究构建了基于DYNC1I1、RNASE1两个关键ARGs胃癌预后风险模型,该模型可有效预测胃癌患者预后.
文献关键词:
胃癌;自噬;癌症基因数据库;预后预测模型;列线图
作者姓名:
罗志鹏;苗志国;金瑞日;魏海云
作者机构:
江西省肿瘤医院腹部肿瘤外科,江西南昌 330029;南昌大学第一附属医院消化内科,江西南昌 330006
文献出处:
引用格式:
[1]罗志鹏;苗志国;金瑞日;魏海云-.基于多数据库筛选胃癌的自噬相关基因及预后预测模型的建立)[J].中国医药科学,2022(13):44-47
A类:
DYNC1I1
B类:
自噬相关基因,预后预测模型,癌症基因数据库,数据库构建,ARGs,GSEA,分子特征,特征数据,自噬基因,GEO,差异表达基因,富集分析,通路分析,COX,选关,生存曲线分析,列线图,下载,Lasso,多因素分析,RNASE1,生存期预测,校正曲线,预测能力,研究构建,预后风险模型,胃癌患者
AB值:
0.266489
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