典型文献
识别糖酵解相关LncRNA对头颈鳞状细胞癌的预后价值
文献摘要：
目的 探究糖酵解相关的长链非编码RNA(lncRNA)在头颈鳞状细胞癌(SCCHN)发生、发展中的作用.方法 在TCGA数据库和MSigDB数据库中,获取SCCHN患者的正常组织和癌组织的RNA测序信息和糖酵解基因,通过"limma"包筛选出差异的lncRNA和糖酵解基因,并对差异糖酵解基因进行GO和KEGG功能富集分析;通过Pearson相关分析并筛选出lncRNA后,通过单因素和多因素Cox回归分析构建基于lncRNA表达的风险模型;绘制Kaplan-Meier生存曲线、ROC曲线及决策曲线,通过ESTIMATE估计免疫和基质评分确定SC-CHN高/低风险组在信号通路、免疫微环境、免疫检查点、m6A相关基因方面的差异.结果 总共筛选出298个GRLs,通过单因素Cox回归分析确定了60个具有显著预后价值的GRLs,并成功构建了GRLs的风险模型,ROC曲线证明了模型的准确性;相较于高风险组,低风险组免疫细胞浸润增加,并且m6 A调节因子和免疫检查点表达均升高.结论 基于GRLs的预后指标是SCCHN患者预后的独立风险因素,是潜在的生物标志物和治疗靶点.
文献关键词：
头颈鳞状细胞癌;糖酵解;lncRNA;风险模型;免疫学
中图分类号：
作者姓名：
孙一驰;曾宪琳;张世超
作者机构：
贵州医科大学 医学影像学院,贵州 贵阳 550025;贵州省细胞免疫治疗工程研究中心,贵州 贵阳 550025;贵州省普通高等学校感染免疫与抗体工程特色重点实验室,贵州 贵阳 550025
文献出处：
引用格式：
[1]孙一驰;曾宪琳;张世超-.识别糖酵解相关LncRNA对头颈鳞状细胞癌的预后价值)[J].贵州医科大学学报,2022(04):426-432,438
A类：
SCCHN,GRLs
B类：
LncRNA,对头,头颈鳞状细胞癌,预后价值,长链非编码,lncRNA,TCGA,MSigDB,正常组织,癌组织,糖酵解基因,limma,出差,功能富集分析,Cox,风险模型,Kaplan,Meier,生存曲线,决策曲线,ESTIMATE,免疫和基质评分,低风险组,免疫微环境,免疫检查点,m6A,总共,高风险组,免疫细胞浸润,调节因子,预后指标,独立风险因素,生物标志物,治疗靶点,免疫学
AB值：
0.263593
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