典型文献
胰腺癌患者BZW1和BZW2表达水平及其与预后的相关性分析
文献摘要:
目的 探讨基本亮氨酸拉链和含W2结构域的蛋白质1、2(BZW1,BZW2)对胰腺癌患者的预后价值.方法 截至2021年12月,提取癌症基因组图谱-胰腺腺癌(TCGA-PAAD)数据库中4名健康和178例胰腺癌患者的RNA-seq数据和对应的临床信息以及基因型-组织表达数据库(GTEx)中167名健康人胰腺组织的RNA-seq数据.比较胰腺癌组织和正常组织中BZW1和BZW2的表达差异;受试者工作特征(ROC)曲线分析BZW1和BZW2在胰腺癌和正常组织中的预测准确性;时间依赖ROC曲线分析BZW1和BZW2的表达与时间相关的结局的预测效能;蛋白-蛋白互作网络(PPI)筛选与BZW1和BZW2相互作用的基因;京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)分析共表达基因的生物学功能和作用途径;免疫浸润分析BZW1和BZW2与免疫细胞的相关性;采用Kaplan-Meier曲线分析BZW1和BZW2的表达水平对胰腺癌患者预后的影响.结果 BZW1和BZW2在胰腺癌组织中的表达水平高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05);ROC曲线分析显示,BZW1和BZW2的曲线下面积(AUC)和95%置信区间(CI)分别为0.974(0.954~0.994)和0.944(0.918~0.970);时间依赖ROC曲线分析显示,BZW1的表达预测胰腺癌患者1、3、5年总生存期的概率分别为0.611、0.673、0.825;BZW2的表达预测胰腺癌患者1、3、5年总生存期的概率分别为0.623、0.584、0.601;BZW1、BZW2及其共表达基因主要定位于细胞核膜上,具有翻译启动因子活性,参与细胞质翻译起始复合物的形成;BZW1与Th2细胞、T辅助细胞、Tcm细胞、Th1细胞、中性粒细胞和巨噬细胞呈正相关,与pDC细胞和Th17细胞呈负相关(P<0.05).BZW2仅与Th2细胞呈正相关,与NK细胞、TFH细胞、pDC、肥大细胞、细胞毒性细胞、iDC细胞、B细胞、T细胞、CD8 T细胞、嗜酸性粒细胞、树突状细胞、Tem细胞呈负相关(P<0.05).高表达BZW1与患者的主要治疗结果有关,而高表达BZW2与T分期、M分期、肿瘤分期和病理分级有关(P<0.05).单因素Cox回归分析显示,BZW1、BZW2可作为预测胰腺癌患者总生存期的风险因子,高表达BZW1的胰腺癌患者拥有更短的总生存期、疾病特异性生存期和无进展间期,而高表达BZW2的胰腺癌患者拥有更短的总生存期和无进展间期.结论 BZW1和BZW2在胰腺癌组织中异常高表达,其水平升高与胰腺癌患者的不良预后有密切关系.因此,BZW1和BZW2可作为胰腺癌患者潜在的预后标志物.
文献关键词:
BZW1;BZW2;胰腺癌;预后标志物;生物信息学
中图分类号:
作者姓名:
漆处梅;唐小龙
作者机构:
达州市妇女儿童医院检验科,四川 达州 635000;滨州医学院第一临床医学院,山东 滨州 256600
文献出处:
引用格式:
[1]漆处梅;唐小龙-.胰腺癌患者BZW1和BZW2表达水平及其与预后的相关性分析)[J].医学信息,2022(21):26-33,39
A类:
BZW1,BZW2,iDC
B类:
亮氨酸,拉链,结构域,预后价值,癌症基因组图谱,TCGA,PAAD,seq,临床信息,基因型,组织表达,GTEx,健康人,胰腺组织,胰腺癌组织,正常组织,表达差异,受试者工作特征,预测准确性,时间依赖,预测效能,蛋白互作网络,PPI,京都基因与基因组百科全书,基因本体论,共表达基因,生物学功能,作用途径,免疫浸润,免疫细胞,Kaplan,Meier,癌旁组织,置信区间,总生存期,细胞核,核膜,细胞质,复合物,Th2,助细胞,Tcm,巨噬细胞,pDC,Th17,NK,TFH,肥大细胞,细胞毒性,CD8,嗜酸性粒细胞,树突状细胞,Tem,治疗结果,肿瘤分期,病理分级,Cox,风险因子,疾病特异性生存期,无进展间期,不良预后,密切关系,预后标志物
AB值:
0.208266
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