典型文献
基于转录因子的肺癌预后模型构建及临床意义
文献摘要:
目的:分析转录因子(transcription factors, TFs)在肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)中的表达及与预后的关系,寻找潜在干预靶点。方法:利用生物信息学方法挖掘癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas Program, TCGA)数据库中LUAD组织转录组和临床数据,利用R语言软件对肺癌及癌旁组织中的TFs相关基因(transcription factors-related genes, TFGs)进行表达差异分析,筛选出肺癌组织中差异表达的TFGs,进行GO功能和KEGG通路富集分析。通过COX回归分析筛选关键TFGs,建立风险评分模型并对其预测能力进行评价。结果:与癌旁组织比较,LUAD组织中有391个TFGs表达异常。TFGs主要涉及胚胎发育、转录调控及干细胞多能行调节等生物学过程和信号通路。单因素COX回归分析显示11个TFs显著影响LUAD预后,逐步多因素COX回归分析筛选出其中5个TFGs (IRX4、ID3、CDX2、E2F7、NPAS2)作为肺癌预后的危险因子用于构建风险评分模型。生存分析显示,低风险组总生存时间显著长于高风险组。风险评分可作为危险因素预测LUAD预后(风险比为1.906,P<0.01),而患者年龄、性别、肿瘤分期与预后无相关性(P>0.05)。结论:LUAD中多个TFs基因存在异常表达,基于5个TFGs成功构建了风险评分模型,可有效预测LUAD预后,为临床诊疗提供参考。
文献关键词:
支气管肺癌;转录因子;预后模型;临床意义
中图分类号:
作者姓名:
何晓梅;王兴敏;熊浚智;陈荣荣;闵迁;张克斌;李园园
作者机构:
400037 重庆,陆军军医大学第二附属医院临床医学研究中心
文献出处:
引用格式:
[1]何晓梅;王兴敏;熊浚智;陈荣荣;闵迁;张克斌;李园园-.基于转录因子的肺癌预后模型构建及临床意义)[J].中华肺部疾病杂志(电子版),2022(04):462-467
A类:
IRX4
B类:
预后模型,transcription,factors,TFs,肺腺癌,lung,adenocarcinoma,LUAD,干预靶点,利用生物,生物信息学方法,癌症基因组图谱,Cancer,Genome,Atlas,Program,TCGA,转录组,临床数据,癌旁组织,related,genes,TFGs,表达差异,肺癌组织,差异表达,通路富集分析,COX,选关,风险评分模型,预测能力,胚胎发育,转录调控,能行,生物学过程,ID3,CDX2,E2F7,NPAS2,生存分析,低风险组,总生存时间,高风险组,风险比,患者年龄,肿瘤分期,无相,异常表达,临床诊疗,支气管肺癌
AB值:
0.354633
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