目的 基于TCGA数据库构建肾透明细胞癌(ccRCC)细胞焦亡相关基因预后模型.方法 从TCGA数据库下载509例ccRCC及71例癌旁正常组织的转录组数据和临床数据,获取差异表达焦亡基因;一致性聚类将ccRCC患者分为两个亚型,基于两亚型间的差异基因,进行Lasso-Cox回归构建预后模型,计算预后评分;根据最佳截止值,将ccRCC患者分为高风险组和低风险组,绘制Kaplan-Meier生存曲线,比较两组生存差异;绘制ROC曲线,评价预后模型的预测能力,将预后评分和临床病理因素纳入Cox回归分析ccRCC患者的预后影响因素,构建列线图,评估预测与实际生存概率的一致性;GSEA、GSVA分析比较高风险组和低风险组信号通路间差异,通过ESTIMATE、CIBERSORT和quanTlseq三种算法比较高风险组与低风险组免疫细胞浸润的差异,比较两组免疫检查点基因表达水平,预测高、低风险组对免疫治疗的反应.结果 共筛选23个上调和1个下调的差异焦亡基因,确定了 2种ccRCC亚型,筛选出248个可作为独立预后特征的差异基因,通过LASSO回归,最终纳入10个焦亡相关基因构建预后模型;预后风险评分=1.0518×C10orf90+0.0845×HS3ST3A1+0.0407×SAA1-0.324×MPP7+0.2061×IGF2BP3+0.0566×ADAMTS14+0.2176×CILP-0.0119×SHOX2-0.1069×TRIM2+0.3367×HHIPL2;Kaplan-Meier生存分析显示,低风险组比高风险组有生存优势(P＜0.001);Cox回归分析显示,风险评分是ccRCC患者预后独立影响因素(P＜0.001);GSEA、GSVA分析显示,高风险组主要富集在免疫相关通路,低风险组主要富集在代谢相关通路;免疫细胞浸润分析显示,高风险组含有更高水平的免疫抑制细胞;免疫治疗反应预测结果显示,低风险组有更高的反应率.结论 ccRCC焦亡相关基因预后模型可用于预测ccRCC患者的预后,可以作为免疫治疗反应的预测指标,有利于进一步指导临床治疗.

肾透明细胞癌;细胞焦亡;预后模型;免疫浸润;免疫治疗

毛伟;张琳;刘清钊

重庆市南岸区人民医院药剂科,重庆400060;陆军军医大学第一附属医院药剂科,重庆400038;重庆市南岸区人民医院肾内科,重庆400060

医学信息

[1]毛伟;张琳;刘清钊-.肾透明细胞癌细胞焦亡相关基因预后模型的建立与应用)[J].医学信息,2022(14):1-9

quanTlseq,C10orf90+0,HS3ST3A1+0,MPP7+0,IGF2BP3+0,ADAMTS14+0,CILP,TRIM2+0,HHIPL2

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