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典型文献
生物信息学分析与分子对接紫英抗炎合剂治疗慢性盆腔炎分析
文献摘要:
目的 探讨紫英抗炎合剂治疗湿热瘀结型慢性盆腔炎的作用机制.方法 通过自研Python脚本在TCMSP数据库中筛选紫英抗炎合剂的活性成分和靶基因,并通过人类基因数据库GeneCards获得湿热瘀结型慢性盆腔炎的靶基因,使用CytoScape3.9.0构建"药物-成分-靶点"、"成分-通路"网络.将筛选到的关键靶基因导入STRING在线平台,建立蛋白与蛋白相互作用网络,并进行生物信息分析以研究其机制.最后通过AutoDockTools和AutoDock vina进行分子对接分析,并与医院现有的西药的结合度进行对比后应用PyMol可视化作图.结果 ①从紫英抗炎合剂中筛选出豆甾醇等59个中药有效活性成分,白细胞介素6、肿瘤坏死因子等72个关键基因;②生物信息分析结果显示,紫英抗炎合剂生物学过程和功能集中在调节炎症反应、细胞因子活性等;③生物信息分析信号通路显示,紫英抗炎合剂治疗慢性盆腔炎主要涉及PI3K-Akt信号通路、NF-κB信号通路等;④分子对接结果显示紫英抗炎合剂中的重要活性成分与慢性盆腔炎的核心靶点结合较好,甚至优于阿奇霉素和头孢西丁,筛选出结合度好、有氢键形成的构象关系IL6-Stigmasterol进行可视化处理.结论 以上研究为紫英抗炎合剂日后进一步探索提供了新思路,也为通过网络药理学、生物信息分析和分子对接的方法,发展医院的新制剂提供了新的研究途径.
文献关键词:
湿热瘀结型慢性盆腔炎;中药复方;紫英抗炎合剂;生物信息分析;分子对接
作者姓名:
朱洁;王青华;赵丹丹
作者机构:
浙江中医药大学附属湖州中医院药剂科,浙江湖州 313000
文献出处:
引用格式:
[1]朱洁;王青华;赵丹丹-.生物信息学分析与分子对接紫英抗炎合剂治疗慢性盆腔炎分析)[J].中国现代医生,2022(36):6-13
A类:
紫英抗炎合剂
B类:
生物信息学分析,分子对接,湿热瘀结型慢性盆腔炎,Python,脚本,TCMSP,活性成分,人类基因,基因数据库,GeneCards,CytoScape3,关键靶基因,STRING,在线平台,蛋白相互作用网络,生物信息分析,AutoDockTools,vina,西药,结合度,PyMol,作图,豆甾醇,关键基因,生物学过程,功能集,PI3K,Akt,核心靶点,阿奇霉素,头孢西丁,氢键,构象,IL6,Stigmasterol,可视化处理,网络药理学,新制,研究途径,中药复方
AB值:
0.242457
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