典型文献
不同抗逆性菠萝品种的差异基因和差异代谢物分析
文献摘要:
该研究对2个不同抗逆性的菠萝品种PZ2(抗逆性较差)和PZ3(抗逆性强)进行转录组和代谢组比较分析,以探索品种间抗逆性差异的分子生理机制,为菠萝抗性育种提供理论依据.(1)转录组结果显示,以PZ2为对照,在2个品种间共筛选到1667个差异表达基因,上调和下调的差异表达基因分别为770个和897个;其中筛选到20个与抗逆性相关的差异表达基因,包括WRKY和MYB转录因子基因以及ASR3、SOD1、POD48、HSP20、GSTF1、GSTU17等基因.(2)代谢组分析表明,以PZ2为对照,在2个品种间共筛选到208个差异代谢物,含量上调和下调的差异代谢物分别为98个和110个,其中22种差异代谢物与抗逆性相关,包括氨基酸及其衍生物、脂类、黄酮类、糖类和糖苷等.(3)qRT-PCR分析验证表明,所选的8个差异表达基因在菠萝品种PZ2与PZ3中的差异表达趋势与转录组测序中差异基因表达水平变化趋势基本一致.(4)关联分析表明,差异表达基因和差异代谢物共同富集的通路有类黄酮生物合成,苯丙素生物合成,莨宕烷、哌啶和吡啶丙酸盐生物合成,半胱氨酸与蛋氨酸代谢等4条.研究发现,抗逆性强的菠萝品种的非生物逆境反应相关基因、抗氧化酶基因、逆境响应结构基因和调控基因的表达水平高于抗逆性较差的品种,且黄酮类、氨基酸衍生物类及木脂素、脂质等代谢物的含量也高于抗逆性较差的品种.
文献关键词:
菠萝;不同品种;差异表达基因;差异代谢物
中图分类号:
作者姓名:
刘传和;贺涵;邵雪花;赖多;匡石滋;肖维强
作者机构:
广东省农业科学院果树研究所,农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室,广东省热带亚热带果树研究重点实验室,广州 510640
文献出处:
引用格式:
[1]刘传和;贺涵;邵雪花;赖多;匡石滋;肖维强-.不同抗逆性菠萝品种的差异基因和差异代谢物分析)[J].西北植物学报,2022(09):1514-1522
A类:
PZ2,PZ3,ASR3,POD48,GSTF1,GSTU17
B类:
抗逆性,菠萝,差异代谢物分析,种间,生理机制,抗性育种,差异表达基因,WRKY,MYB,SOD1,HSP20,代谢组分析,种差,脂类,黄酮类,糖类,糖苷,qRT,分析验证,转录组测序,差异基因表达,基因表达水平,表达水平变化,类黄酮,生物合成,苯丙素,哌啶,吡啶,丙酸,蛋氨酸,酸代谢,非生物逆境,抗氧化酶,酶基因,逆境响应,结构基因,调控基因,氨基酸衍生物,生物类,木脂素,不同品种
AB值:
0.249735
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