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基于转录组的不同火龙果品种抗性差异分析
文献摘要：
不同的品种抗性不同,为进一步探究不同火龙果品种之间的抗性差异,为后续火龙果抗性育种提供参考,该研究利用Illumina HiSeq 2000测序平台对'普通白肉'(BR)和'厄瓜多尔黄龙'(EY)两个品种进行转录组测序分析,并参考GO Ontology、KEGG等公共数据库对差异表达基因进行功能分类与富集分析.结果表明:(1)BR与EY共有14248个差异基因,其中5446个基因上调,8802个基因下调.(2)相关GO功能分析表明这些差异基因主要参与酶催化活性、细胞组分、代谢过程等,其中参与氧化还原酶活性的349个差异基因在BR中表达量上调.(3)KEGG通路分析显示,大部分差异基因富集在新陈代谢和生物合成等,其中参与角质、木栓质和蜡质生物合成的差异基因有12个,如CYP86和CER1等.参与氧化还原酶活性的差异基因在BR中较EY表达量上调,且显著富集,表明BR与EY在生长发育和细胞代谢过程差异显著.参与角质、木栓质和蜡质生物合成的差异基因在BR中表达量上调,此类基因在BR中具有较高的表达量且显著富集,表明BR可能具有较强的抗旱和抗病能力.
文献关键词：
火龙果;转录组;品种;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
李健星;谭艳芳;李冬兴;王斌;陈婷;黄甫昭;陆树华
作者机构：
广西壮族自治区中国科学院 广西植物研究所,广西 桂林541006;广西喀斯特植物保育与恢复生态学重点实验室,广西壮族自治区中国科学院 广西植物研究所,广西 桂林541006
文献出处：
引用格式：
[1]李健星;谭艳芳;李冬兴;王斌;陈婷;黄甫昭;陆树华-.基于转录组的不同火龙果品种抗性差异分析)[J].广西植物,2022(02):183-190
A类：
CYP86,CER1
B类：
火龙果,果品,品种抗性,抗性育种,研究利用,Illumina,HiSeq,测序平台,白肉,BR,厄瓜多尔,黄龙,EY,转录组测序分析,Ontology,公共数据库,差异表达基因,功能分类,富集分析,差异基因,功能分析,酶催化活性,代谢过程,氧化还原酶,通路分析,基因富集,新陈代谢,生物合成,角质,木栓质,蜡质,细胞代谢,抗旱,抗病能力
AB值：
0.275332
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