典型文献
转录组与代谢组联合分析菠萝网纱覆盖防寒机制
文献摘要:
本研究以不覆盖为对照(CK),通过转录组、代谢组进行基因表达和代谢物差异分析,探究冬季菠萝黑色网纱覆盖防寒(FH)的生理及分子机制.转录组分析表明,与CK相比,FH中筛选到1125个差异表达基因,其中表达上调和下调基因分别为417个和708个.差异基因主要富集在淀粉和蔗糖代谢、内质网蛋白加工、苯丙素生物合成和氨基酸生物合成等通路;筛选出19个与防寒相关的候选关键差异基因,包括WRKY、MYB、bHLH等转录因子基因及ERD6-like、β-葡萄糖苷酶等酶基因.代谢组分析表明,与CK相比,FH中筛选到151个差异代谢物,包括含量上调57个和含量下调94个.差异代谢物主要富集在嘌呤和嘧啶代谢、氨基酸类代谢、脂类代谢和黄酮类代谢等通路;筛选出26个与防寒相关的关键差异代谢物,主要包括类黄酮、氨基酸、多胺、脂和糖类等.本研究结果表明,黑色网纱覆盖通过影响菠萝相关基因差异表达和代谢物变化来调控菠萝生长发育,安全越冬,为今后指导菠萝冬季防寒,挖掘菠萝耐寒功能基因奠定基础.
文献关键词:
菠萝;网纱覆盖;防寒;差异表达基因;差异代谢物
中图分类号:
作者姓名:
刘传和;贺涵;何秀古;赖秋勤;刘开;邵雪花;赖多;匡石滋;肖维强
作者机构:
广东省农业科学院果树研究所农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广东省热带亚热带果树研究重点实验室,广州 510640;广东省农业科学院,广州 510640
文献出处:
引用格式:
[1]刘传和;贺涵;何秀古;赖秋勤;刘开;邵雪花;赖多;匡石滋;肖维强-.转录组与代谢组联合分析菠萝网纱覆盖防寒机制)[J].生物技术通报,2022(11):58-69
A类:
网纱覆盖,ERD6
B类:
联合分析,菠萝,防寒,代谢物差异,FH,转录组分析,差异表达基因,蔗糖代谢,内质网,苯丙素,生物合成,选关,关键差异基因,WRKY,MYB,bHLH,like,葡萄糖苷酶,酶基因,代谢组分析,差异代谢物,嘌呤,嘧啶,氨基酸类,脂类代谢,黄酮类,类黄酮,多胺,糖类,基因差异表达,代谢物变化,安全越冬,耐寒,功能基因
AB值:
0.291542
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