首站-论文投稿智能助手
典型文献
白粉菌诱导月季对甜菜夜蛾产生抗性的关键候选基因筛选及CYP71的生物信息学分析
文献摘要:
[目的]通过检测白粉菌侵染月季后转录组基因的表达量变化,筛选白粉菌诱导月季产生对甜菜夜蛾抗性的关键候选基因,为月季抗虫基因的功能研究及抗虫品种的培育提供参考.[方法]以月季品种艳粉(Rosa chinensis Jacq.)为研究材料,利用二代测序技术对白粉菌侵染月季前后基因的表达量进行转录组测序.利用RSEM对基因的表达水平进行定量分析,DESeq2软件进行表达差异分析,利用KOBAS将得到的差异表达基因进行KEGG富集分析.对筛选出的可能参与三萜类物质生物合成的CYP71D差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)进行生物信息学分析,并分析了CYP71D蛋白与抗虫性的关系.[结果]转录组测序共检测到差异表达基因1646个,共643个差异表达基因被富集到81条KEGG通路中,其中31个差异表达基因与萜类合成相关.生物信息学分析结果表明了CYP71D亚家族的物种特异性.在植物中CYP71A主要参与类单萜的生物合成,CYP71D主要参与单萜类、倍半萜类、二萜类、三萜类等与抗病、虫有关的次生代谢物的生物合成.[结论]月季细胞色素P450超家族蛋白酶中CYP71簇的CYP71A、CYP71D亚家族可能与三萜化合物Dehydro(11,12)ursolic acid lactone(DUA)的生物合成有关,表明CYP71D家族蛋白参与修饰三萜化合物的底物识别位点,本研究为探索寄主植物介导的间接的病虫互作机理的研究提供了一定的思路.
文献关键词:
月季;白粉菌;三萜类化合物;甜菜夜蛾;CYP71;生物信息学
作者姓名:
刘思琪;杨琦;王科建;李云仙;杨发忠
作者机构:
西南林业大学西南地区林业生物质资源高效利用国家林业与草原局重点实验室,云南 昆明 650224
文献出处:
引用格式:
[1]刘思琪;杨琦;王科建;李云仙;杨发忠-.白粉菌诱导月季对甜菜夜蛾产生抗性的关键候选基因筛选及CYP71的生物信息学分析)[J].福建农业学报,2022(12):1601-1611
A类:
CYP71,艳粉,CYP71D,CYP71A,Dehydro,DUA
B类:
白粉菌,月季,甜菜夜蛾,候选基因筛选,生物信息学分析,侵染,抗虫基因,功能研究,抗虫品种,Rosa,chinensis,Jacq,二代测序技术,转录组测序,RSEM,DESeq2,表达差异,KOBAS,差异表达基因,富集分析,三萜类物质,生物合成,Differentially,expressed,genes,DEGs,抗虫性,萜类合成,亚家族,单萜,倍半萜类,二萜类,次生代谢物,细胞色素,P450,超家族,三萜化合物,ursolic,acid,lactone,白参,底物识别位点,寄主植物,病虫,互作机理,三萜类化合物
AB值:
0.275884
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。