典型文献
大豆根系响应早期缺铁胁迫的转录组分析
文献摘要:
[目的]本文旨在探明2个大豆品种根系对早期缺铁胁迫的响应差异.[方法]以铁高效品种'吉育99'和铁低效品种'吉育93'大豆为材料进行水培试验,将对照(25μmol?L-1 Fe)和早期(1和6 h)缺铁胁迫(1μmol?L-1 Fe)处理的大豆根系进行转录组测序.[结果]与对照相比,铁高效大豆品种差异基因数随着缺铁胁迫时间的延长而增加,而铁低效品种差异基因数随着胁迫时间的延长而降低.差异表达基因(differential expression gene,DEG)的KEGG通路富集结果表明,缺铁胁迫处理1 h,2个大豆品种在苯丙烷生物合成、倍半萜和三萜生物合成、植物病原体相互作用、植物MAPK信号通路、淀粉和蔗糖代谢等代谢通路中的相关基因表达有显著差异.缺铁胁迫处理6 h,2个大豆品种在苯丙烷生物合成、倍半萜和三萜生物合成、类黄酮生物合成、谷胱甘肽代谢等代谢通路中的相关基因表达有显著差异.差异表达基因转录因子分析结果表明,铁高效大豆品种受早期缺铁胁迫调控的转录因子家族主要有AP2/ERF-ERF、C2H2、MYB、WRKY、bHLH、NAC,铁低效大豆品种中转录因子家族主要有AP2/ERF-ERF、MYB、WRKY、bHLH、NAC.[结论]缺铁胁迫1 h大豆就能对缺铁胁迫作出响应,且不同铁效率大豆品种在苯丙烷生物合成、转录因子调控等相关基因的表达存在显著差异.
文献关键词:
大豆;缺铁胁迫;早期;转录组;差异表达基因
中图分类号:
作者姓名:
王婷婷;陈鸽;包悦琳;金东淳
作者机构:
延边大学农学院,吉林 延吉133000
文献出处:
引用格式:
[1]王婷婷;陈鸽;包悦琳;金东淳-.大豆根系响应早期缺铁胁迫的转录组分析)[J].南京农业大学学报,2022(02):224-234
A类:
B类:
根系,缺铁胁迫,转录组分析,大豆品种,响应差异,水培试验,转录组测序,品种差异,差异基因,差异表达基因,differential,expression,gene,DEG,通路富集,集结,胁迫处理,苯丙烷,生物合成,倍半萜,三萜,植物病原体,MAPK,蔗糖代谢,代谢通路,相关基因表达,类黄酮,谷胱甘肽代谢,基因转录,胁迫调控,AP2,ERF,C2H2,MYB,WRKY,bHLH,NAC,铁效率
AB值:
0.221233
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