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典型文献
马铃薯氮代谢对低氮胁迫的响应及转录组分析
文献摘要:
[目的]探究不同氮效率马铃薯品种氮代谢对低氮胁迫的响应及分子机制,为马铃薯氮高效育种及高产栽培提供理论依据.[方法]以氮高效马铃薯品种冀张薯12号和氮低效马铃薯品种尤佳70为材料,采用盆栽试验方式,设置低氮(3 mmol/L纯氮)和正常施氮(15 mmol/L纯氮)处理,在出苗后30 d测定植株的干质量、氮积累量及氮代谢相关酶(硝酸还原酶(NR)、亚硝酸还原酶(NiR)、谷氨酰胺合成酶(GS)、谷氨酸合成酶(GOGAT))活性,并依托Illumina HiSeq 2000平台进行转录组测序分析.利用DESeq进行差异基因分析,通过GO富集和KEGG Pathway数据库注释参与马铃薯氮胁迫响应的差异表达基因.[结果]2种施氮量下冀张薯12号茎叶和根系的干质量、氮积累量以及NR、NiR、GS、GOGAT活性均高于尤佳70.与正常施氮相比,低氮胁迫下2个马铃薯品种茎叶和根系的干质量、氮积累量及叶片的NR和NiR活性均显著降低,根系的GS活性显著提高;尤佳70叶片的GS活性、GOGAT活性和根系的GOGAT活性均显著降低,冀张薯12号根系的NiR活性显著降低.转录组分析结果表明,在2个施氮量对比组中,尤佳70叶片和根系中的差异表达基因分别有6 173个和249个,冀张薯12号叶片和根系中的差异表达基因分别有3 455个和1 990个.GO和KEGG结果显示,冀张薯12号的差异基因主要涉及氮代谢、氨基酸代谢等生物过程,尤佳70的差异基因主要涉及光合作用等生物过程.尤佳70和冀张薯12号根系中富集到氮代谢通路的差异基因分别有1个和8个,叶片中分别有11个和8个.尤佳70和冀张薯12号叶片的氨基酸相关代谢途径中涉及上调差异表达基因最多的均是苯丙氨酸代谢,其中编码苯丙氨酸解氨酶、肉桂酸-4-羟化酶、4-香豆酸-CoA连接酶的基因表达显著上调.[结论]在低氮条件下,氮高效品种冀张薯12号氮代谢相关酶活性较高,能减缓低氮胁迫对氮代谢的影响,进而保证较高的氮效率.
文献关键词:
马铃薯;氮胁迫;氮代谢酶活性;转录组分析
作者姓名:
张婷婷;孟丽丽;刘晓蕊;陈有君;刘坤雨;袁昊田;蒙美莲
作者机构:
内蒙古农业大学农学院,内蒙古呼和浩特010018;内蒙古自治区农牧业科学院,内蒙古呼和浩特010031;沧州师范学院生命科学学院,河北沧州061001;内蒙古农业大学生命科学学院,内蒙古呼和浩特010018
引用格式:
[1]张婷婷;孟丽丽;刘晓蕊;陈有君;刘坤雨;袁昊田;蒙美莲-.马铃薯氮代谢对低氮胁迫的响应及转录组分析)[J].西北农林科技大学学报(自然科学版),2022(08):15-26
A类:
B类:
低氮胁迫,转录组分析,氮效率,马铃薯品种,育种,高产栽培,尤佳,盆栽试验,试验方式,出苗,定植,植株,干质量,氮积累量,氮代谢相关酶,NR,亚硝酸还原酶,NiR,谷氨酰胺合成酶,GS,谷氨酸,GOGAT,Illumina,HiSeq,转录组测序分析,DESeq,差异基因分析,Pathway,胁迫响应,差异表达基因,施氮量,茎叶,叶和根,根系,种茎,氨基酸代谢,生物过程,光合作用,中富,代谢通路,代谢途径,调差,苯丙氨酸解氨酶,肉桂酸,羟化酶,香豆酸,CoA,连接酶,氮高效品种,氮代谢酶活性
AB值:
0.234292
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