典型文献
综合生理学和转录组学揭示芦竹耐盐的候选基因
文献摘要：
为了丰富芦竹(A rundo donax)的耐盐基因资源并为耐盐育种提供理论基础.本研究对长势一致的芦竹分别用不同浓度的NaCl盐溶液处理36 h,测定与抗逆相关的生理指标,同时进行转录组测序和生物信息学分析.结果表明:本次盐胁迫对芦竹的脯氨酸和可溶性糖含量影响较为明显,而其他生理指标变化不显著,说明其对盐环境可能并不十分敏感,具有一定的耐受性.对样本间的差异表达基因进行筛选,共筛选到166个核心差异表达基因,而一些差异倍数较大的基因可能在盐响应的过程中发挥着重要作用.GO与KEGG的富集结果表明芦竹通过硝酸盐、一氧化氮、活性氮、活性氧、类黄酮生物合成等相关途径来响应盐胁迫.利用WGCNA构建差异表达基因的共表达网络,筛选出与脯氨酸含量变化相关的hub基因.总之,本研究为芦竹耐盐基因的挖掘提供依据,也为今后的分子育种奠定了理论基础.
文献关键词：
芦竹;盐胁迫;生理;转录组;WGCNA
中图分类号：
作者姓名：
孙源长;罗琳;林辉;林冬梅;林占熺
作者机构：
福建农林大学国家菌草工程技术研究中心,福建福州350002
文献出处：
引用格式：
[1]孙源长;罗琳;林辉;林冬梅;林占熺-.综合生理学和转录组学揭示芦竹耐盐的候选基因)[J].草地学报,2022(10):2558-2571
A类：
rundo
B类：
生理学,转录组学,芦竹,候选基因,donax,耐盐基因,基因资源,耐盐育种,长势,NaCl,盐溶液,抗逆,生理指标,转录组测序,生物信息学分析,盐胁迫,可溶性糖含量,指标变化,耐受性,差异表达基因,倍数,集结,硝酸盐,一氧化氮,活性氮,类黄酮,生物合成,相关途径,WGCNA,共表达网络,脯氨酸含量,含量变化,hub,总之,分子育种
AB值：
0.348487
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