典型文献
β-珠蛋白基因远程相互作用元件的筛选与功能性分析
文献摘要：
目的:研究表明β-珠蛋白基因在发育过程中呈现选择表达的转换机制,其上游的基因座位点控制区(LCR)调控了β-珠蛋白基因家族的表达模式.为了深入探究β-珠蛋白基因表达调控的分子网络,本文对其他可能参与调控β-珠蛋白基因表达的远程调控元件进行筛选,对β-珠蛋白基因动态调控转换机制进行深入研究.方法:早幼粒细胞经全反式维甲酸诱导分化,以β-珠蛋白基因启动子区及LCR作为环形染色体构象捕获(4C)技术分析的靶位点,通过测序技术与调控元件分析结合,在全基因组筛选与β-珠蛋白家族基因座位发生相互作用关系的位点.结果:根据4C测序结果,筛选出与HBD启动子区及LCR存在相互作用关系的位点.通过染色体构象捕获(3C)验证,结果与测序结果一致.通过甲醛辅助分离调控元件技术及Epiregio在线网站对调控元件功能性分析,结果表明筛选位点AC105129.4、AL354707.17、AC078785.22及AC021646.35均为潜在的参与β-珠蛋白基因调控元件.结论:4C筛选位点与锚定位点相互作用表明了β-珠蛋白家族基因座位在细胞核内复杂的空间组织形式.
文献关键词：
β-珠蛋白基因;环形染色体构象捕获;染色质相互作用;染色体构象捕获
中图分类号：
作者姓名：
肖亦舒;许兰;刘春亚;杜乐;孙元田;李冬娜;任立成
作者机构：
海南医学院生物学教研室,海南 海口 571199
文献出处：
引用格式：
[1]肖亦舒;许兰;刘春亚;杜乐;孙元田;李冬娜;任立成-.β-珠蛋白基因远程相互作用元件的筛选与功能性分析)[J].海南医学院学报,2022(24):1841-1847
A类：
环形染色体构象捕获,Epiregio,AC105129,AL354707,AC078785,AC021646,染色质相互作用
B类：
珠蛋白基因,转换机制,基因座,座位,控制区,LCR,基因家族,表达模式,基因表达调控,分子网络,远程调控,动态调控,早幼粒细胞,全反式维甲酸,诱导分化,基因启动子区,4C,靶位,全基因组筛选,白家,家族基因,相互作用关系,HBD,3C,甲醛,线网,基因调控,锚定,定位点,细胞核,空间组织,组织形式
AB值：
0.220647
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