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基于生物信息学分析UBE2C、TTK和CP对卵巢癌预后的影响
文献摘要：
目的 基于生物信息学分析筛选与卵巢癌预后不良相关的重要基因.方法 从基因表达汇编数据库获得表达谱,鉴定出|logFC|>1.5和P<0.05的差异表达基因(DEG),进行功能富集、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建、功能模块分析、生存分析和相关性分析.结果 首先,确定135个表达一致的基因,33个上调DEG主要富集在有丝分裂纺锤体组装检查点、染色体分离调控等;102下调DEG主要富集在神经递质水平的调节、蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性的调控等.然后构建PPI网络,筛选20个hub基因并进行生存分析和表达相关性分析,同时筛选符合要求的模块并分别对基因进行途径富集分析.最后,取交集得到UBE2C、TTK、CP在卵巢癌中高表达并且导致预后不良.结论 通过基于数据库的生物信息学综合分析,筛选出影响卵巢癌患者预后的3个关键候选基因,这些基因可为治疗提供新思路.
文献关键词：
转录组分析;差异表达基因;卵巢癌;预后
中图分类号：
作者姓名：
马惠涵;秘嘉庆;秦倩;马梅杰;冯勤梅
作者机构：
山西医科大学第五临床医学院,山西太原 030001;山西医科大学附属人民医院妇科,山西太原 030012
文献出处：
引用格式：
[1]马惠涵;秘嘉庆;秦倩;马梅杰;冯勤梅-.基于生物信息学分析UBE2C、TTK和CP对卵巢癌预后的影响)[J].中国医药导报,2022(04):22-27
A类：
B类：
生物信息学分析,UBE2C,TTK,CP,预后不良,良相,基因表达汇编,表达谱,logFC,差异表达基因,DEG,功能富集,蛋白质相互作用,PPI,网络构建,功能模块,生存分析,有丝分裂,纺锤体组装,检查点,神经递质水平,丝氨酸,苏氨酸,激酶活性,hub,符合要求,富集分析,交集,卵巢癌患者,候选基因,转录组分析
AB值：
0.344154
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