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凉血通瘀方干预高血压大鼠急性脑出血模型对脑组织中差异miRNA表达的影响
文献摘要：
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制.方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C).适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,B组灌胃等体积生理盐水,连续5天,每天1次.构建脑出血模型后收集脑组织,借助全转录组测序技术获得miRNA表达量,与miRBase数据库比对获取已知miRNA,使用miRDeep2预测新miRNA.差异分析软件为DESeq2,筛选阈值为|log2FC|>=1并且P<0.05.对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集和PPI网络分析.结果 实验组和对照组对比,共发现21个显著差异表达的miRNA,上调有9个,下调有12个,共预测得到1243个有统计学意义的靶基因.GO富集分析发现,生物过程中突触囊泡分泌的调节、神经递质分泌的调节和神经递质运输的调节占前三位,神经元投射终点、全膜、质膜区域和细胞投射则是主要的细胞成分.分子功能分别为小GTPase绑定、底物特异性跨膜转运蛋白活性和离子跨膜转运体活性.通路分析结果显示,靶基因在癌证通路、pI3K-Akt信号通路、人类乳头瘤病毒感染、神经活性配体-受体相互作用和MAPK通路等分布广泛.采用STRING网站和Cytoscape软件,根据MCC算法筛选出ADRA2C、CASR、CCL28、CCR1、DRD2、GNAT3、GRM2、DYNC1LI1、GABBR1、GNAI1等核心靶基因.结论 凉血通瘀方对脑出血急性期鼠脑组织内miRNA的表达有重要影响;显著差异表达miRNAs可能通过靶向核心基因调控凉血通瘀方干预急性脑出血的病理过程及预后.
文献关键词：
凉血通瘀方;miRNA;高通量测序;大鼠脑组织;差异表达;急性脑出血
中图分类号：
作者姓名：
李薇懿;李国春;魏乐心;钱勤;郭晴晴;杨诗锦;杨晓娟;王鹏程;陈杨
作者机构：
南京中医药大学公共卫生系 南京 210023
文献出处：
引用格式：
[1]李薇懿;李国春;魏乐心;钱勤;郭晴晴;杨诗锦;杨晓娟;王鹏程;陈杨-.凉血通瘀方干预高血压大鼠急性脑出血模型对脑组织中差异miRNA表达的影响)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(05):1933-1943
A类：
凉血通瘀方,miRDeep2,pI3K,ADRA2C,GNAT3,GRM2,DYNC1LI1,GABBR1,GNAI1
B类：
急性脑出血,差异表达,药效机制,自发性高血压大鼠,饲养,一周,灌胃,生理盐水,全转录组测序,转录组测序技术,技术获得,miRBase,库比,DESeq2,log2FC,靶基因预测,对靶,通路富集,PPI,富集分析,生物过程,突触囊泡,泡分,神经递质,前三位,投射,全膜,质膜,细胞成分,GTPase,绑定,底物特异性,跨膜转运蛋白,蛋白活性,膜转运体,通路分析,Akt,人类乳头瘤病毒感染,MAPK,STRING,Cytoscape,MCC,CASR,CCL28,CCR1,DRD2,脑出血急性期,miRNAs,核心基因,基因调控,病理过程,大鼠脑组织
AB值：
0.294919
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