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典型文献
基于网络药理学方法研究"黄芪-人参"药对治疗胃癌的作用机制
文献摘要:
目的:应用网络药理学方法探讨"黄芪-人参"药对治疗胃癌的作用机制.方法:依托中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索"黄芪-人参"中药化学成分、作用靶点,并通过人类基因数据库(the human gene da-tabase,GeneCards)、比较毒物基因组学数据库(CTD)得到胃癌相关基因,探寻"黄芪-人参"药对中与胃癌相关的作用靶点,建立"化合物-靶点"网络图;依据STRING平台构建蛋白-蛋白相互作用网络(protein-protein interactions,PPI),筛选出核心靶点,提交到生物信息注释数据库(DAVID)进行基因富集分析,获得基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)及KEGG富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)注释结果.结果:依据筛选条件[口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、药物相似性(drug-likeness,DL)≥0.18)]共得到41个活性成分,其中黄芪20个,人参22个,药物潜在靶点384个.2个疾病数据库中共收集到200个疾病靶点.通过韦恩图筛选出黄芪-人参作用于胃癌的22个关键靶点,通过degree值做PPI网络进行功能分析,共选出5个关键靶点,主要涉及丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、丝裂原活化蛋白激酶8、胱天蛋白酶3、前列腺素内过氧化物合成酶2、胱天蛋白酶9等.GO生物过程分析以P<0.01通过靶基因筛选出排名靠前的条目,主要包括血管平滑肌增殖、凋亡过程、对细胞因子的反应、染色质结合、DNA结合、蛋白质同聚活性等.KEGG富集结果筛选出与胃癌相关的前20条信号通路,主要涉及神经营养蛋白信号通路、Toll样受体信号通路、肿瘤坏死因子等.结论:"黄芪-人参"药对通过调控致癌物质代谢、免疫耐药、炎症反应,对癌症的发生、转移及耐药发挥防治胃癌的作用.
文献关键词:
中药;网络药理学;胃癌;机制;黄芪-人参
作者姓名:
郭凯凯;赵艺蔓;陈晓宇;凌慧;李洲强;郭东霖;张颖;侯恩存
作者机构:
广西中医药大学附属瑞康医院,广西 南宁 530011
文献出处:
引用格式:
[1]郭凯凯;赵艺蔓;陈晓宇;凌慧;李洲强;郭东霖;张颖;侯恩存-.基于网络药理学方法研究"黄芪-人参"药对治疗胃癌的作用机制)[J].西部中医药,2022(11):40-46
A类:
B类:
网络药理学,黄芪,药对,胃癌,系统药理学,分析平台,traditional,Chinese,medicine,systems,pharmacology,database,analysis,platform,TCMSP,中药化学成分,作用靶点,人类基因,基因数据库,human,GeneCards,毒物,基因组学数据库,CTD,网络图,STRING,平台构建,蛋白相互作用网络,protein,interactions,PPI,核心靶点,提交,交到,注释数据库,DAVID,基因富集分析,基因本体论功能富集,功能富集分析,ontology,kyoto,encyclopedia,genes,genomes,口服生物利用度,oral,bioavailability,OB,drug,likeness,DL,活性成分,中黄,潜在靶点,共收,韦恩图,关键靶点,degree,功能分析,共选,丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶,丝裂原活化蛋白激酶,胱天蛋白酶,前列腺素,合成酶,生物过程,过程分析,靶基因,基因筛选,条目,血管平滑肌,染色质,同聚,集结,神经营养,Toll,样受体,致癌物质,物质代谢,免疫耐药
AB值:
0.408858
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