典型文献
基于网络药理学探析化痰消瘀方治疗食管癌的机制
文献摘要:
目的:利用网络药理学方法来评估化痰消瘀方治疗食管癌机制和潜在目标靶点.方法:化痰消瘀方有效成分从TCMSP及Swiss Target Prediction数据库中获取的.从GeneCards、DisGeNet和OMIM数据库下载与食管癌相关的目标基因.蛋白质-蛋白质相互作用网络是使用String数据库和Cytoscape构建的.最后,采用基因本体论(GO)和京都基因与基因组学百科全书(KEGG)对目标靶点进行基因和基因组富集分析.使用AutoDock Vina对活性成分和目标基因之间的关系进行建模.结果:在食管癌中相关的基因中,158个与化痰消瘀的靶点重叠,主要包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Akt Serine/Threonine Kinase,AKT)1、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)、肿瘤蛋白P53(Tumor Protein P53,TP53)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)8、半胱氨酸蛋白酶(Caspase,CASP)3等.这些靶点中前20个相互作用的蛋白质通过KEGG及GO富集分析表明,共同靶点参与了多种生物学过程和途径,包括DNA合成调控、基因表达调控、RNA代谢调控,缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1信号通路和肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路等.分子对接分析表明,活性成分与靶标蛋白能较好的结合.结论:本研究为深入分析化痰消瘀方作用机制提供了理论基础,为临床应用和潜在的新药开发提供思路.
文献关键词:
网络药理;食管癌;分子对接
中图分类号:
作者姓名:
王勇;孙林科
作者机构:
重庆市江北区中医院,重庆,400020
文献出处:
引用格式:
[1]王勇;孙林科-.基于网络药理学探析化痰消瘀方治疗食管癌的机制)[J].中医临床研究,2022(25):35-38
A类:
B类:
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AB值:
0.42603
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