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典型文献
不同氮效率玉米品种响应氮肥减施的差异表达基因分析
文献摘要:
为了研究不同氮效率玉米品种伟科518(氮高效品种,WK518)、农大108(氮低效品种,ND108)在氮减施条件下的差异表达基因(Differently expressed genes,DEG)及其功能,在不同氮条件下[正常氮(225 kg/hm2,HN)、低氮(0 kg/hm2,LN)],对灌浆中期WK518和ND 108穗位叶进行高通量转录组测序,筛选DEG,进行GO和KEGG富集分析,并对差异表达的转录因子进行分析.结果表明,低氮条件下,在WK518与ND108对比组中共检测到2065个上调表达基因、2319个下调表达基因.正常氮条件下,在WK518与ND108对比组中共检测到2368个上调表达基因、3780个下调表达基因.WK518在不同氮条件下共检测到1009个上调表达基因、2268个下调表达基因.ND108在不同氮条件下共检测到364个上调表达基因、510个下调表达基因.低氮条件下,WK518与ND108中的DEG主要富集于尿卟啉-Ⅲ C-甲基转移酶活性、甘露糖-6-磷酸异构酶活性、氧化-还原过程、线粒体组织、核染色质等GO条目,氨基糖及核苷酸糖新陈代谢,苯丙氨酸新陈代谢,类单萜生物合成,甘氨酸、丝氨酸及苏氨酸新陈代谢、碱基剪切修复等KEGG代谢通路.正常氮条件下,WK518与ND108中的DEG主要富集于气孔关闭、跨膜受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性、叶绿体基质、类囊体、叶绿体被膜等GO条目,光合作用生物体中碳固定、氨基糖及核苷酸糖新陈代谢、糖酵解/糖异生、丙氨酸新陈代谢、光合作用-天线蛋白等KEGG代谢通路.WK518在不同氮条件下的DEG主要富集于几丁质反应、蛋白质磷酸化、生物膜、吲哚硫代葡萄糖苷代谢过程、肌醇半乳糖苷-蔗糖半乳糖基转移酶等GO条目,光合作用生物体中碳固定、植物激素信号传导、内质网内蛋白质加工过程、植物-病原体相互作用、植物MAPK信号通路等KEGG代谢通路.ND108在不同氮条件下的DEG主要富集于干旱胁迫响应、毒素分解代谢过程、几丁质酶活性、海藻糖生物合成过程、海藻糖-磷酸酶活性等GO条目,乙醛酸及二羧酸盐新陈代谢、植物MAPK信号通路、灵菌素生物合成、玉米素生物合成、生物素新陈代谢等KEGG代谢通路.不同氮条件下,在WK518和ND108中共检测出58个差异表达转录因子家族,包括GRAS、bHLH、MYB相关、NAC、C3H、ERF、C2H2、WRKY、FAR1等植物中重要的调控生长发育、生物及非生物胁迫响应的转录因子家族.
文献关键词:
玉米;氮肥减施;氮效率;高通量转录组测序;差异表达基因
作者姓名:
李川;张盼盼;张美微;牛军;赵霞;何冠华;乔江方
作者机构:
河南省农业科学院粮食作物研究所,河南郑州450002;宝丰县农业科学研究所,河南宝丰467400
文献出处:
引用格式:
[1]李川;张盼盼;张美微;牛军;赵霞;何冠华;乔江方-.不同氮效率玉米品种响应氮肥减施的差异表达基因分析)[J].河南农业科学,2022(09):10-24
A类:
WK518,ND108
B类:
氮效率,玉米品种,氮肥减施,差异表达基因分析,氮高效品种,农大,Differently,expressed,genes,DEG,hm2,HN,低氮,LN,灌浆,穗位叶,叶进,高通量转录组测序,富集分析,尿卟啉,甲基转移酶,甘露糖,异构酶,还原过程,染色质,条目,氨基糖,新陈代谢,苯丙氨酸,单萜,生物合成,甘氨酸,丝氨酸,碱基,代谢通路,气孔,膜受体,苏氨酸蛋白激酶,激酶活性,叶绿体,类囊体,光合作用,生物体,中碳,碳固定,糖酵解,糖异生,天线,蛋白质磷酸化,生物膜,吲哚,硫代葡萄糖苷,代谢过程,肌醇,半乳糖,蔗糖,糖基转移酶,植物激素,激素信号传导,内质网,网内,蛋白质加工,加工过程,病原体,MAPK,干旱胁迫响应,分解代谢,几丁质酶,海藻糖,合成过程,磷酸酶活性,乙醛酸,二羧酸,羧酸盐,菌素,玉米素,生物素,GRAS,bHLH,MYB,NAC,C3H,ERF,C2H2,WRKY,FAR1,生物及非生物胁迫
AB值:
0.307353
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