典型文献
猪肾上皮细胞SLA-1基因的克隆及分子结构特征分析
文献摘要：
[目的]利用猪肾上皮细胞15(PK15)建立系统的猪白细胞抗原1(SLA-1)抗原表位筛选系统.[方法]提取PK15细胞总RNA,设计特异性引物,应用RT-PCR方法扩增SLA-1基因(SLA-1 * PK15),将该基因克隆到pMD18-T载体上,并进行双酶切及测序鉴定;利用DNAMAN 5.2.2、Mega 5.0、Multalin及同源建模进行系统进化树、二级结构、三级结构分析.[结果]RT-PCR扩增获得约1 400 bp条带,质粒提取和酶切鉴定结果表明SLA-1成功插入pMD18-T载体;测序结果证实该基因共1 419 bp,其中2-1 087 bp为编码区,共编码361个氨基酸,信号肽为21个氨基酸,符合SLA-1基因特征.进化树分析结果显示,SLA-1 * PK15与SLA-1 * wxd(中国梅山猪)和SLA-1 * 0401(中国巴马小型猪)进化关系最近,而与SLA-1 * lr02(丹麦长白猪)及SLA-1 * 0509(中国西藏野猪)进化关系较远.胞外区氨基酸比较分析表明,PK15细胞SLA-1基因与其他SLA-1基因胞外区主要变异位点存在于α1区和α2区,α3区的变异位点较少,无特征性氨基酸变异位点.PK15细胞SLA-1蛋白的二级结构主要以α-螺旋和β-折叠为主.同源建模结果显示,SLA-1蛋白具有SLAclass Ⅰ典型的三级结构,α1区和α2区构成抗原多肽结合区.[结论]SLA-1基因稳定存在于PK15细胞,PK15细胞具有作为SLA-1抗原表位筛选系统的潜在应用价值.
文献关键词：
猪肾上皮细胞15(PK15);猪白细胞抗原1(SLA-1);克隆;生物信息学分析;同源模建
中图分类号：
作者姓名：
王宝宝;金行;鲜钰涵;冯宏盛;高凤山
作者机构：
大连大学生命科学与技术学院,大连116622
文献出处：
引用格式：
[1]王宝宝;金行;鲜钰涵;冯宏盛;高凤山-.猪肾上皮细胞SLA-1基因的克隆及分子结构特征分析)[J].中国畜牧兽医,2022(05):1671-1678
A类：
Multalin,wxd,lr02,SLAclass
B类：
上皮细胞,分子结构,PK15,建立系统,抗原表位,选系,特异性引物,基因克隆,pMD18,双酶,DNAMAN,Mega,同源建模,模进,系统进化树,二级结构,三级结构,bp,条带,质粒,编码区,信号肽,基因特征,进化树分析,梅山猪,巴马小型猪,进化关系,丹麦,长白猪,中国西藏,野猪,较远,胞外区,基因胞,变异位点,特征性,氨基酸变异,折叠为,多肽,定存,潜在应用,生物信息学分析,同源模建
AB值：
0.290079
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