典型文献
黔北麻羊GPx3基因克隆、生物信息学分析及在不同性腺组织中的表达分析
文献摘要:
为探究GPx3基因在产单、多羔黔北麻羊不同性腺组织中的表达规律及其蛋白质的结构与功能,本实验以黔北麻羊为研究对象,采集单、多羔黔北麻羊的下丘脑、垂体、子宫、输卵管和卵巢提取总RNA,运用qRT-PCR技术,分析GPx3基因mRNA在单、多羔黔北麻羊5个不同性腺组织中的表达水平;PCR法扩增克隆黔北麻羊GPx3基因的CDS区;生物信息学分析并预测黔北麻羊GPx3蛋白的结构与功能.qRT-PCR结果显示:GPx3基因在单、多羔黔北麻羊的5个不同性腺组织中均有表达,且均在卵巢的表达量最高;除下丘脑外,其余各组织在多羔组中的表达量均极限著高于单羔组.T克隆结果表明:黔北麻羊GPx3基因CDS区序列为681 bp,与NCBI上收录的山羊的mRNA序列同源性达99.85%.生物信息学分析发现:黔北麻羊GPx3蛋白可能位于细胞外,且具有信号肽,属于不稳定的亲水性分泌蛋白,其三级结构主要由无规则卷曲和α-螺旋构成;遗传进化树分析得出,黔北麻羊GPx3基因与绵羊的遗传距离最近,与鸡的遗传距离最远.本研究对GPx3基因进行了克隆和生物信息学分析,并揭示了GPx3基因在黔北麻羊不同性腺组织中的表达差异性,为进一步探究GPx3基因对黔北麻羊繁殖性状的调控机制提供基础.
文献关键词:
黔北麻羊;GPx3基因;克隆;生物信息学分析;荧光定量PCR
中图分类号:
作者姓名:
付开斌;陈祥;周志楠;张艳;惠茂茂;洪磊
作者机构:
贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳 550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳 550025
文献出处:
引用格式:
[1]付开斌;陈祥;周志楠;张艳;惠茂茂;洪磊-.黔北麻羊GPx3基因克隆、生物信息学分析及在不同性腺组织中的表达分析)[J].中国畜牧杂志,2022(01):77-84
A类:
GPx3
B类:
黔北麻羊,基因克隆,生物信息学分析,性腺组织,表达分析,多羔,表达规律,蛋白质的结构与功能,下丘脑,垂体,输卵管,qRT,CDS,bp,NCBI,上收,山羊,序列同源性,信号肽,亲水性,分泌蛋白,其三,三级结构,无规则,卷曲,遗传进化树,进化树分析,绵羊,遗传距离,最远,表达差异,繁殖性状,调控机制
AB值:
0.191778
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