典型文献
泡菜母水细菌群落组成及潜在基因功能分析
文献摘要:
为探究泡菜母水中细菌群落组成及潜在功能基因的多样性,采用扩增子测序变体对密闭储存于25℃下、培养不同时长的泡菜母水中细菌群落组成进行分析,并对所得细菌序列进行基因功能预测分析.储存1、8、30 d的泡菜母水中细菌alpha多样性存在差异,但其优势菌群组成相似.从泡菜母水获得细菌20门、33纲、79目、92科、320属、388种.门水平上:厚壁菌门和变形菌门占比均较高,在1、8、30 d中占比分别为52.52%和52.96%、47.55%和47.46%、45.68%和52.17%.泡菜母水中优势属(占总体系含量>1%)有8个:肠杆菌属、明串珠菌属、未分类的肠杆菌属、乳球菌属、柠檬酸杆菌属、未分类的乳杆菌属、未分类的乳酸杆菌属、拉恩氏菌属;稀有属(占总体系含量<0.01%)种类较多,共有99个,在不同储存时长泡菜母水中的组成差异较大;未能鉴别的细菌类群有1门38科89属173种.泡菜母水中能够注释的功能基因有6个类型364种,主要与新陈代谢、遗传信息、细胞转化、致病、环境信息处理和有机系统相关.
文献关键词:
扩增子测序;特殊生境;细菌多样性;基因功能预测;泡菜母水
中图分类号:
作者姓名:
李政强;邓巍;安睿;张发;李静超;杨晓燕
作者机构:
大理大学东喜玛拉雅研究院,云南大理671003;云南省高校洱海流域保护与可持续发展研究重点实验室,云南大理671003;三江并流区域生物多样性保护与利用云南省创新团队,云南大理671003;中国三江并流区域生物多样性协同创新中心,云南大理671003
文献出处:
引用格式:
[1]李政强;邓巍;安睿;张发;李静超;杨晓燕-.泡菜母水细菌群落组成及潜在基因功能分析)[J].食品研究与开发,2022(24):188-194
A类:
泡菜母水
B类:
细菌群落组成,基因功能分析,功能基因,扩增子测序,变体,密闭,基因功能预测,预测分析,alpha,优势菌群,菌群组成,厚壁菌门,变形菌门,优势属,肠杆菌属,明串珠菌,未分类,柠檬酸杆菌,乳杆菌属,乳酸杆菌,拉恩氏菌,稀有,细菌类群,新陈代谢,遗传信息,细胞转化,环境信息,信息处理,机系统,特殊生境,细菌多样性
AB值:
0.250858
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