典型文献
南极磷虾原肌球蛋白纯化鉴定、理化特性及模拟表位肽预测
文献摘要：
对南极磷虾原肌球蛋白(tropomyosin,TM)进行提取纯化与质谱鉴定,并对其热稳定性、pH值稳定性及消化稳定性进行研究,同时利用生物信息学对其进行序列同源性分析、空间结构同源建模及过敏原模拟表位肽识别.十二烷基硫酸钠聚丙烯酰氨凝胶电泳结果显示,经蛋白粗提、热除杂、等电点沉淀、硫酸铵盐析等多步提纯,最终仅在32 kDa附近得到一条清晰条带.利用超高效液相色谱-质谱联用对其进行扫描,经UniProt数据库检索确定该目的蛋白为TM(Euphausia superba),蛋白分子质量32.6 kDa,肽段覆盖率达97％.同源性分析结果表明南极磷虾TM是一种高度保守蛋白,与26种甲壳动物的TM序列同源性在88％～98.2％之间.南极磷虾TM对热、酸碱及胃液消化均具有较强的稳定性,而对肠液消化稳定性较差,易被胰蛋白酶和糜蛋白酶降解生成低分子质量肽段.通过DNAStar Protean、ANTHEPROT、BepiPred 1.0 server、ABCpred server、Immunomedicine Group 5种生物信息学工具最终预测识别出8条南极磷虾TM模拟表位肽(EAQNKETNAKADKADDEVH、DLERSEERLN、TKLAEASQAADESER、EADRKYDE、ERAEERAEAG、VSEEKANQREEAYKEQI、RSVQKLQKEVDR、VNEKEKYKGI),并在其空间结构中进行一一映射.本研究为南极磷虾TM模拟表位肽的精准预测识别及其相关低致敏性产品的开发提供了科学依据.
文献关键词：
南极磷虾;原肌球蛋白;提取纯化;蛋白鉴定;稳定性;生物信息学;模拟表位肽
中图分类号：
作者姓名：
王珊;刘瑶;刘柯欣;张书琪;林松毅;孙娜
作者机构：
大连工业大学食品学院,辽宁大连 116034;国家海洋食品工程技术研究中心,辽宁大连 116034;海洋食品精深加工关键技术省部共建协同创新中心,辽宁大连 116034
文献出处：
引用格式：
[1]王珊;刘瑶;刘柯欣;张书琪;林松毅;孙娜-.南极磷虾原肌球蛋白纯化鉴定、理化特性及模拟表位肽预测)[J].食品科学,2022(24):117-128
A类：
模拟表位肽,ANTHEPROT,Immunomedicine,EAQNKETNAKADKADDEVH,DLERSEERLN,TKLAEASQAADESER,EADRKYDE,ERAEERAEAG,VSEEKANQREEAYKEQI,RSVQKLQKEVDR,VNEKEKYKGI
B类：
南极磷虾,虾原肌球蛋白,蛋白纯化,纯化鉴定,理化特性,tropomyosin,TM,提取纯化,质谱鉴定,热稳定性,消化稳定性,利用生物,序列同源性,同源性分析,同源建模,过敏原,十二烷基硫酸钠,聚丙烯,凝胶电泳,除杂,等电点,硫酸铵,铵盐,盐析,多步,提纯,kDa,条带,超高效液相色谱,UniProt,数据库检索,目的蛋白,Euphausia,superba,甲壳动物,酸碱,胃液,肠液,胰蛋白酶,糜蛋白酶,酶降解,低分子质量肽,DNAStar,Protean,BepiPred,server,ABCpred,Group,生物信息学工具,一一映射,精准预测,致敏性,蛋白鉴定
AB值：
0.307806
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