典型文献
白来航鸡半乳糖凝集素-1基因克隆、生物信息学及组织表达特性分析
文献摘要：
[目的]克隆白来航鸡半乳糖凝集素-1(galectin-1,Gal-1)基因,对其编码蛋白进行生物信息学分析,并检测其在不同组织中的表达情况,为进一步阐明其抗病毒功能提供科学依据.[方法]以鸡脾脏cDNA为模板,通过PCR扩增鸡Gal-1基因完整CDS区序列,并进行相似性比对及系统进化树构建;运用生物信息学软件对其编码蛋白的理化性质、亲/疏水性、跨膜区、信号肽、修饰结构、保守结构域及高级结构进行预测.利用实时荧光定量PCR检测Gal-1基因在白来航鸡心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脑、腺胃、肌胃、十二指肠、空肠、盲肠、直肠、胸肌和腿肌组织中的表达情况.[结果]白来航鸡Gal-1基因CDS区序列长度为408 bp,编码135个氨基酸.相似性比对结果表明,白来航鸡Gal-1基因核苷酸序列与火鸡、绿头鸭和珍珠鸟的相似性分别为97.1％、88.4％和82.2％;系统进化树结果表明,白来航鸡与火鸡亲缘关系最近.Gal-1蛋白分子质量为15.06 ku,理论等电点为6.57,不稳定系数为36.05,脂肪系数为74.30,平均亲水指数为-0.259.Gal-1蛋白无信号肽,不存在跨膜区;存在2个明显的亲水区,其编码蛋白较稳定,为亲水性蛋白.二级结构预测显示,Gal-1蛋白以无规则卷曲(45.93％)和延伸链(41.48％)为主,三级结构预测结果与二级结构一致.实时荧光定量PCR结果显示,Gal-1基因mRNA在白来航鸡组织中广泛表达,在肺脏中表达量最高,在脑中表达最低.[结论]本研究成功克隆了白来航鸡Gal-1基因CDS区序列,Gal-1基因在白来航鸡心脏、肝脏等14种组织中广泛表达,结果可为鸡Gal-1蛋白功能的深入研究提供参考.
文献关键词：
白来航鸡;Galectirr1基因;基因克隆;生物信息学;组织表达
中图分类号：
作者姓名：
张凯;夏宇欣;王立强;侯少阳;温海燕;葛仕豪;周宛蓉;姜莉莉;樊兆斌
作者机构：
菏泽学院药学院,菏泽274015
文献出处：
引用格式：
[1]张凯;夏宇欣;王立强;侯少阳;温海燕;葛仕豪;周宛蓉;姜莉莉;樊兆斌-.白来航鸡半乳糖凝集素-1基因克隆、生物信息学及组织表达特性分析)[J].中国畜牧兽医,2022(10):3736-3745
A类：
Galectirr1
B类：
白来航鸡,半乳糖凝集素,基因克隆,组织表达特性,galectin,编码蛋白,生物信息学分析,不同组织,抗病毒,脾脏,cDNA,CDS,系统进化树,进化树构建,生物信息学软件,疏水性,信号肽,保守结构域,鸡心,肺脏,十二指肠,空肠,盲肠,胸肌,腿肌,肌组织,bp,火鸡,绿头鸭,珍珠鸟,亲缘关系,分子质量,ku,等电点,不稳定系数,水区,亲水性,二级结构,结构预测,无规则,卷曲,三级结构,蛋白功能
AB值：
0.277851
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