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杜长大猪CIDEa基因克隆及其组织表达分析
文献摘要：
本实验旨在克隆杜长大猪(三元杂交猪)诱导细胞凋亡DNA片段化因子45样效应子A(CIDEa)基因序列,通过生物学软件分析CIDEa基因序列,利用实时荧光定量(qPCR)方法检测杜长大猪不同组织中CIDEa基因mRNA的表达量.实验成功获得杜长大猪CIDEa基因CDS区,长度为660 bp,共编码218个氨基酸.杜长大猪CIDEa基因与NCBI已公布野猪、牛、马、犬、人和家鼠的CIDEa基因同源性分别为99.2％、84.8％、81.5％、80.6％、80％、76.1％.与野猪CIDEa基因相比,发生5处碱基突变,分别为第99 C-T、第355 T-C、第609 G-A、第627 C-T,为同义突变,第173 T-C脯氨酸突变为亮氨酸.CIDEa蛋白二级结构预测结果显示,α-螺旋占45.41％,无规则卷曲占33.49％,延伸链占15.14％,β-转角占5.96％;CIDEa蛋白三级结构与二级结构相一致.qPCR结果显示,CIDEa基因在腹脂和皮下脂肪中表达量最高,在肝脏、肾脏、肺脏和心脏中均有表达,在背最长肌中表达量最低.结论表明:CIDEa基因在脂肪沉积中可能起着重要作用.
文献关键词：
杜长大猪;CIDEa基因;克隆;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
罗云彦;谢红月;潘鹏;胡旭旭;甄锐;蒋钦杨;黄艳娜
作者机构：
广西大学动物科学技术学院,广西南宁 530004
文献出处：
引用格式：
[1]罗云彦;谢红月;潘鹏;胡旭旭;甄锐;蒋钦杨;黄艳娜-.杜长大猪CIDEa基因克隆及其组织表达分析)[J].中国畜牧杂志,2022(01):108-112
A类：
CIDEa
B类：
杜长大猪,基因克隆,组织表达分析,三元杂交,片段化,效应子,基因序列,qPCR,不同组织,CDS,bp,NCBI,野猪,家鼠,同源性,碱基突变,同义突变,脯氨酸,亮氨酸,蛋白二级结构,结构预测,无规则,卷曲,三级结构,相一致,腹脂,皮下脂肪,肺脏,背最长肌,脂肪沉积
AB值：
0.245088
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