[目的]扩增猪血清和糖皮质激素诱导型激酶(SGK)家族基因并进行生物信息学分析,探索其在猪脂肪组织和细胞中的表达模式.[方法]以藏猪脂肪细胞cDNA为模板PCR扩增SGK家族基因,通过在线工具预测其编码蛋白的理化性质及亚细胞定位;用Mega X软件构建系统进化树;采集30日龄巴马猪心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肺脏、背肌、腿肌、颈部脂肪、背部脂肪、腹股沟脂肪、肾周脂肪等组织及7日龄和4月龄猪腹股沟脂肪组织,通过实时荧光定量PCR检测SGK家族基因在猪不同部位组织中的表达;采集30日龄巴马猪腹股沟脂肪组织并分离基质血管成分(SVF)细胞,诱导SVF细胞向白色脂肪细胞分化,通过实时荧光定量PCR检测SGK家族基因及脂肪分化标记基因CCAAT增强子结合蛋白α(C/EBPa)、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARγ)在脂肪细胞中的表达.[结果]SGK1、SGK2和SGK3基因CDS区序列长度分别为1 296、1 104和1 473 bp,分别编码431、367和490个氨基酸;SGK1和SGK2定位于细胞质,SGK3定位于细胞核,三者均为亲水性蛋白,3个蛋白均含有相同基序,保守性高;系统进化树结果表明,猪与牛的亲缘关系最近;SGK1和SGK3基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、多种肌肉及脂肪组织广泛表达,SGK2基因在颈部、背部、腹股沟、肾周脂肪组织中均有较高表达;SGK1和SGK2基因在7日龄猪脂肪组织中表达量极显著高于4月龄猪脂肪组织(P＜0.01),SGK3基因在4月龄和7日龄的猪脂肪组织中表达量无显著差异(P＞0.05),且SGK3基因的表达量低于SGK1和SGK2基因;与未分化脂肪细胞相比,在分化后的脂肪细胞中SGK1和SGK2基因的表达量极显著上调(P＜0.01),且SGK1基因的表达量远高于SGK2基因,而SGK3基因的表达量无显著变化(P＞0.05).[结论]SGK家族蛋白具有保守结构域,可能发挥着相似的功能,SGK1和SGK2可能参与调控猪脂肪细胞的分化过程,结果可为探究猪脂肪沉积的分子机制提供一定的理论基础.

猪;SGK家族基因;脂肪沉积;表达分析

陈川河;刘嘉莉;张立兰;赵莹;陶聪

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;岭南现代农业科学与技术广东实验室,广州510642

中国畜牧兽医

[1]陈川河;刘嘉莉;张立兰;赵莹;陶聪-.猪SGK家族基因的生物信息学分析及其在猪脂肪组织和细胞中的表达)[J].中国畜牧兽医,2022(09):3310-3320

EBPa,SGK2

家族基因,生物信息学分析,猪脂肪,脂肪组织,猪血,糖皮质激素,激素诱导,诱导型,表达模式,藏猪,cDNA,编码蛋白,亚细胞定位,Mega,软件构建,建系,系统进化树,日龄,巴马猪,猪心,脾脏,肺脏,腿肌,背部,腹股沟,肾周脂肪,月龄,不同部位,SVF,白色脂肪细胞,脂肪细胞分化,脂肪分化,标记基因,CCAAT,增强子,结合蛋白,过氧化物酶体增殖物激活受体,PPAR,SGK1,SGK3,CDS,bp,分别编,细胞质,细胞核,亲水性,基序,保守性,亲缘关系,组织中表达,未分,保守结构域,细胞的分化,脂肪沉积,表达分析

0.240832