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典型文献
lncRNA-6617调控猪肌内前体脂肪细胞分化的筛选与功能研究
文献摘要:
旨在探究lncRNA-6617的生物学特性及其对猪肌内前体脂肪细胞分化的影响,以及初步探究其上游调节机制,为后续深入研究猪肌内脂肪沉积调控机制提供参考依据.本研究以饲养在相同条件下的1、90、180日龄健康马身公猪(n=3)和大白公猪(n=3)为研究对象,利用RNA-seq技术筛选脂肪型猪(马身猪)和瘦肉型猪(大白猪)肌肉特异表达的IncRNAs,并通过生物信息学分析、RT-PCR及Sanger测序鉴定lncRNA-6617生物学特性及其猪组织中的表达特征.在猪肌内前体脂肪细胞中干扰lncRNA-6617,检测lncRNA-6617对肌内脂肪细胞分化能力的影响.随后,检测m6 A修饰相关酶在不同品种猪中的表达差异,研究lncRNA-6617的上游调控机制.结果显示,lncRNA-6617位于猪18号染色体,RAMP3基因反义链的第3内含子区域,无蛋白编码能力,主要分布于细胞核;lncRNA-6617在猪所检测各组织中均有表达,背部皮下脂肪中表达量最高,且在马身猪肌肉组织中的表达极显著高于大白猪(P<0.01);在猪肌内前体脂肪细胞分化过程中,lncRNA-6617表达量呈上升趋势,且在分化第5天表达量达到最高;干扰lncRNA-6617诱导分化7 d后,分化的成熟脂肪细胞明显减少,成脂关键基因CEBPα、PPARγ和aP2的表达均极显著下调(P<0.01).m6 A修饰的去甲基化酶FTO在马身猪背最长肌和股二头肌中的表达极显著高于大白猪(P<0.01),在腰大肌中的表达显著高于大白猪(P<0.05),上游调节因子ZNF217在马身猪肌肉组织中的表达极显著高于大白猪(P<0.01),与lncRNA-6617表达模式一致.干扰 FTO后,lncRNA-6617的表达极显著下调(P<0.01).本研究筛选了在马身猪肌肉组织中显著高表达的lncRNA-6617,并深入研究了 lncRNA-6617 促进猪肌内前体脂肪细胞分化的功能及其上游调节机制,丰富了脂肪细胞生成的表观调控网络.
文献关键词:
马身猪;lncRNA-6617;m6A;肌内脂肪细胞;成脂分化
作者姓名:
孟珊;杨阳;李睿霄;姬梦婷;张娜;路畅;蔡春波;高鹏飞;郭晓红;曹果清;李步高
作者机构:
山西农业大学动物科学学院,太谷030801
文献出处:
引用格式:
[1]孟珊;杨阳;李睿霄;姬梦婷;张娜;路畅;蔡春波;高鹏飞;郭晓红;曹果清;李步高-.lncRNA-6617调控猪肌内前体脂肪细胞分化的筛选与功能研究)[J].畜牧兽医学报,2022(06):1712-1722
A类:
大白公猪,肌肉特异表达,aP2,ZNF217
B类:
lncRNA,肌内前体脂肪细胞,脂肪细胞分化,功能研究,生物学特性,调节机制,肌内脂肪沉积,调控机制,饲养,日龄,康马,seq,技术筛选,脂肪型,马身猪,瘦肉型猪,大白猪,IncRNAs,生物信息学分析,Sanger,表达特征,肌内脂肪细胞,分化能力,不同品种,种猪,表达差异,RAMP3,反义,内含子区域,蛋白编码,编码能力,细胞核,背部,皮下脂肪,猪肌肉,肌肉组织,诱导分化,关键基因,CEBP,PPAR,去甲基化酶,FTO,背最长肌,股二头肌,腰大肌,调节因子,表达模式,表观调控,调控网络,m6A,成脂分化
AB值:
0.258109
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