典型文献
早期补饲开食料对羔羊瘤胃组织转录组的影响
文献摘要:
瘤胃是反刍动物重要的消化器官,早期补饲开食料可以满足羔羊(Ovis aries)快速生长的营养需要,并促进瘤胃早期发育.本研究通过研究羔羊补饲开食料对瘤胃组织基因表达的影响,旨在阐明开食料对瘤胃发育的作用机理.选取健康的7日龄湖羊公羔22只,随机分为对照组与补饲组,对照组饲喂代乳粉,补饲组在饲喂代乳粉的基础上补饲开食料.28日龄屠宰,采集瘤胃腹囊组织,进行转录组测序分析.结果显示:对照组与补饲组分别获得61.70和58.95 Gb的有效数据,与参考基因组的比对效率在87.85%~89.45%;与对照组相比,补饲后筛选出868个差异表达基因,其中上调基因464个,下调基因404个,主要富集于酶活性、离子通道、膜运输等GO功能及甾类激素生物合成、花生四烯酸代谢、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路、脂肪细胞脂解作用的调节、环腺苷酸等KEGG信号通路.关联性分析显示,含IQ基元GTP酶激活蛋白2重组蛋白(recombinant IQ motif containing GTPase activating protein 2,IQGAP2),溶质载体家族16成员1重组蛋白(recombinant solute carrier family 16,member 1,SLC16A1),锚蛋白重复结构域45(ankyrin repeat domain-containing protein 45,ANKRD45),3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合成酶(3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2,HMGCS2),磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶2(phosophoenolpyruvate carboxykinase 2,PCK2)均与瘤胃乳头长度、乙酸、丙酸、丁酸和总挥发性脂肪酸(total volatile fatty acid,TVFA)显著正相关(P<0.05);而神经酰胺合酶3(ceramide synthase 3,CERS3),角蛋白4重组蛋白(recombinant keratin 4,KRT4),可溶性载质转运蛋白22A17抗体(solute carrier family 22A17,SLC22A1),胰岛素样生长因子结合蛋白6(recombinant insulin like growth factor binding protein 6,IGFBP6)均与其呈显著负相关(P<0.05).说明羔羊补饲开食料后可能是通过调控与瘤胃上皮增殖和养分代谢相关基因的表达量而促进了瘤胃发育.本研究为进一步探讨补饲开食料对瘤胃发育的机理提供了理论依据.
文献关键词:
开食料;羔羊;瘤胃;基因表达;转录组
中图分类号:
作者姓名:
汪晓娟;吕凤;庞鑫;刘国华;赵海碧
作者机构:
甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州730070
文献出处:
引用格式:
[1]汪晓娟;吕凤;庞鑫;刘国华;赵海碧-.早期补饲开食料对羔羊瘤胃组织转录组的影响)[J].农业生物技术学报,2022(03):517-527
A类:
IQGAP2,ANKRD45,phosophoenolpyruvate,CERS3,KRT4,22A17,SLC22A1,IGFBP6
B类:
早期补饲,开食料,羔羊,胃组织,反刍动物,消化器官,Ovis,aries,速生,营养需要,早期发育,瘤胃发育,日龄,湖羊,饲喂,代乳粉,屠宰,腹囊,转录组测序分析,Gb,有效数据,参考基因,差异表达基因,离子通道,甾类,生物合成,花生四烯酸代谢,过氧化物酶体增殖物激活受体,脂肪细胞,脂解,解作,环腺苷酸,关联性分析,基元,激活蛋白,重组蛋白,recombinant,motif,containing,GTPase,activating,protein,溶质载体,solute,carrier,family,member,SLC16A1,锚蛋白,结构域,ankyrin,repeat,domain,辅酶,合成酶,hydroxy,methylglutaryl,CoA,synthase,HMGCS2,磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶,carboxykinase,PCK2,乳头,丙酸,丁酸,挥发性脂肪酸,total,volatile,fatty,acid,TVFA,神经酰胺,ceramide,角蛋白,keratin,转运蛋白,胰岛素样生长因子结合蛋白,insulin,like,growth,binding,养分代谢,代谢相关基因
AB值:
0.364397
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