典型文献
广灵驴分子系谱的建立及群体遗传结构分析
文献摘要：
旨在对广灵县优种驴场保种群体进行调查的基础上构建分子系谱,并对其种群的遗传结构进行分析.本研究采集保种群成年、体况良好的广灵驴(体重350～400 kg)颈静脉血10 mL(n=107),其中公驴13份,母驴94份,抗凝处理后提取全血DNA.采用12个微卫星标记进行荧光PCR扩增后,用ABI3730测序仪进行分型.分型结果采用Cervus 2.0和Pedigraph 2.4软件构建分子系谱,同时采用STRUCTURE2.3和Fstat软件计算群体遗传参数,采用R语言的hclust函数绘制7头公驴及其后代的系统发生NJ树(邻接树).结果 ,对107头种驴进行了分子系谱构建,找到了30头子代的父亲和7头子代的母亲,系谱可靠性＞90％;微卫星标记的平均观测杂合度(H.)和多态信息含量(PIC)分别为0.6765和0.5939,标记遗传多样性较高;NJ树对7个公驴家系进行了聚类;群体分化系数(FST)为0.184,群体平均近交系数(FIT)为0.033,群体内近交系数(FIS)为-0.238,且群体处于哈代-温伯格平衡状态,存在很弱的近交.本研究建立了广灵驴保种群可靠性较高的分子系谱并对其遗传结构进行了分析,证明该群体遗传多态性较高,群体近交系数较低,处于较好的保种状态,具有较大的品种资源开发潜力.
文献关键词：
广灵驴;微卫星标记;分子系谱;群体遗传结构;多态性
中图分类号：
作者姓名：
牛晓艳;曹亮;明世清;李燕平;詹海杰;姜志广;卫顺生;张元庆
作者机构：
山西农业大学动物科学学院,太谷030801;山西省畜禽繁育工作站,太原030001;广灵县优种驴场,广灵037500;山西农业大学动物医学学院,太谷030801
文献出处：
引用格式：
[1]牛晓艳;曹亮;明世清;李燕平;詹海杰;姜志广;卫顺生;张元庆-.广灵驴分子系谱的建立及群体遗传结构分析)[J].畜牧兽医学报,2022(02):391-401
A类：
广灵驴,分子系谱,ABI3730,Pedigraph,STRUCTURE2,Fstat
B类：
群体遗传结构,遗传结构分析,广灵县,优种,保种群体,体况,颈静脉,公驴,母驴,抗凝,全血,微卫星标记,Cervus,软件构建,软件计算,遗传参数,hclust,后代,系统发生,NJ,邻接,头子,子代,父亲,杂合度,多态信息含量,PIC,遗传多样性,家系,群体分化,FST,近交系数,FIT,群体内,FIS,哈代,温伯格,平衡状态,很弱,遗传多态性,品种资源,开发潜力
AB值：
0.295755
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