典型文献
莲雾果实采后木质素合成相关MYB基因家族及其作用分析
文献摘要:
MYB转录因子在植物苯丙烷代谢的调控中具有重要调节作用,对木质素的合成有影响.为解析MYB基因家族在调控采后莲雾果实絮状绵软的分子机制,利用莲雾转录组数据库测序结果和生物信息学方法,对莲雾果实木质素合成相关的20个MYB转录因子基因(MYB基因)的理化性质和结构功能进行预测,并选择在贮藏期间差异表达的1个基因进行克隆和表达,分析其对莲雾果实木质素合成的影响.生物信息学分析表明:20个MYB基因包含91~591个不等的氨基酸残基,定位于细胞核,不存在跨膜结构;二级结构主要由α-螺旋和随机卷曲组成,在所有莲雾果实MYB蛋白中均有分布,20条莲雾MYB蛋白的三级结构绝大部分相似.系统发育树结果表明,莲雾MYB蛋白与番樱桃、巨桉和玫瑰木的亲缘性较近.从莲雾果实中成功克隆得到SsMYB48基因,GenBank登录号为MK204557.1;拟南芥的组织表达结果表明,SsMYB48基因对木质素合成关键酶基因AtF5H和AtPOD的影响较大,说明SsMYB48基因对木质素的合成可能起抑制作用.该研究结果为莲雾MYB基因家族功能的进一步研究提供了理论依据.
文献关键词:
莲雾;MYB转录因子家族;木质素;生物信息学;表达分析
中图分类号:
作者姓名:
聂珂;匡凤元;张珅;吴光斌;陈发河
作者机构:
集美大学食品与生物工程学院,福建厦门361000
文献出处:
引用格式:
[1]聂珂;匡凤元;张珅;吴光斌;陈发河-.莲雾果实采后木质素合成相关MYB基因家族及其作用分析)[J].保鲜与加工,2022(01):92-101,109
A类:
SsMYB48,MK204557,AtF5H,AtPOD
B类:
莲雾,采后,基因家族,作用分析,苯丙烷代谢,絮状,绵软,转录组数据,生物信息学方法,实木,性质和结构,结构功能,贮藏期,差异表达,生物信息学分析,氨基酸残基,细胞核,膜结构,二级结构,卷曲,三级结构,绝大部分,系统发育树,樱桃,巨桉,玫瑰,亲缘性,GenBank,登录号,拟南芥,组织表达,木质素合成关键酶,关键酶基因,表达分析
AB值:
0.24902
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