典型文献
丁香酚-壳聚糖纳米颗粒抑制SO2引起巨峰葡萄采后脱落的转录调控网络预测
文献摘要：
[目的]探究丁香酚-壳聚糖纳米颗粒作为可食用材料对SO2引起的浆果脱落的影响,筛选出抑制浆果脱落的关键候选基因.[方法]对SO2和SO2+丁香酚-壳聚糖纳米颗粒(SN)处理巨峰葡萄(Vitis vinifera L.×V.labrusca L.Kyoho)后贮藏2、4、6 d的样本进行转录组测序.利用GO富集、聚类分析及转录因子调控网络预测对样本间的差异基因进行分析.[结果]GO富集显示差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)参与了多糖代谢、与脱落酸激活的信号通路、细胞壁代谢相关等过程.聚类分析将DEGs分为6个Cluster,丁香酚-壳聚糖纳米颗粒处理诱导Cluster中多种类型转录因子(transcription factors,TFs)差异表达,包括乙烯应答因子(ethylene response factor,ERF)、NAC(NAM、ATAF1/2 和 CUC2)、碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)、碱性亮氨酸拉链(basic-leucine zipper,bZIP)、WRKY、Dof(DNA-binding one zinc finger)、HB-other、同源异型-亮氨酸拉链(homeodomain-leucine zipper,HD-ZIP)、MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)和 MYB_related等类型.转录因子网络预测进一步揭示22个TFs与203个靶基因之间可能存在的调控关系.[结论]筛选出丁香酚-壳聚糖纳米颗粒处理抑制SO2引起葡萄脱落的关键转录因子,并预测其与对应靶基因之间的调控网络图,为进一步揭示可食性包膜抑制葡萄落粒的转录调控机制奠定了理论基础.
文献关键词：
巨峰葡萄;可食性包膜;浆果脱落;转录因子
中图分类号：
作者姓名：
孟祥轩;杨盛迪;李旭飞;郭大龙;裴茂松;刘海楠;韦同路;余义和
作者机构：
河南科技大学园艺与植物保护学院,河南洛阳471023;河南省园艺植物品质调控工程技术研究中心,河南洛阳471023
文献出处：
引用格式：
[1]孟祥轩;杨盛迪;李旭飞;郭大龙;裴茂松;刘海楠;韦同路;余义和-.丁香酚-壳聚糖纳米颗粒抑制SO2引起巨峰葡萄采后脱落的转录调控网络预测)[J].果树学报,2022(06):1099-1110
A类：
浆果脱落,SO2+,可食性包膜
B类：
丁香酚,壳聚糖纳米颗粒,巨峰葡萄,采后,调控网络,可食用,用材,制浆,候选基因,SN,Vitis,vinifera,labrusca,Kyoho,贮藏,转录组测序,差异基因,差异表达基因,differentially,expressed,genes,DEGs,糖代谢,脱落酸,细胞壁代谢,Cluster,多种类型,transcription,factors,TFs,ethylene,response,ERF,NAC,NAM,ATAF1,CUC2,basic,helix,loop,bHLH,碱性亮氨酸拉链,leucine,zipper,bZIP,WRKY,Dof,binding,one,zinc,finger,HB,other,异型,homeodomain,HD,MYB,myb,avian,myeloblastosis,viral,oncogene,homolog,related,子网络,靶基因,关键转录因子,网络图,落粒,转录调控机制
AB值：
0.405992
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