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香樟全基因组WRKY基因家族的鉴定与分析
文献摘要：
WRKY转录因子基因家族是植物特有的一类基因,在植物次生代谢、生物和非生物胁迫中起着重要的调节作用.本研究通过生物信息学方法,在香樟(Cinnamomum camphora(L.)Presl.)全基因组中鉴定了 60个WRKY基因(CcWRKY),并将其分为Group Ⅰ～Ⅲ,其中,Group Ⅰ和Ⅲ的成员发生了收缩现象;片段复制是CcWRKY基因扩张的主要驱动力;Group Ⅰ有完整的WRKY结构域和锌指基序,但Group Ⅱ、Ⅲ存在结构域和锌指基序的丢失和变异现象;CcWRKY基因的启动子区域具有激素类和胁迫类响应顺式作用元件;基因表达分析结果显示,在贫瘠环境(未施肥)中大多数CcWRKY基因在香樟各个组织中高表达,而环境适宜(施肥)条件下,基因表达量降低.
文献关键词：
香樟;WRKY基因;转录因子;生物信息学;表达谱
中图分类号：
作者姓名：
倪辉;孙维红;丁乐;曾伟伟;邹双全
作者机构：
福建农林大学林学院,福州350002;自然生物资源保育利用福建省高校工程研究中心,福州350002
文献出处：
引用格式：
[1]倪辉;孙维红;丁乐;曾伟伟;邹双全-.香樟全基因组WRKY基因家族的鉴定与分析)[J].植物科学学报,2022(04):513-523
A类：
CcWRKY
B类：
香樟,全基因组,基因家族,次生代谢,非生物胁迫,生物信息学方法,Cinnamomum,camphora,Presl,Group,结构域,锌指,基序,启动子区域,激素类,顺式作用元件,基因表达分析,贫瘠,施肥,基因表达量,表达谱
AB值：
0.263485
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