典型文献
甘蔗栽培种WRKY基因家族鉴定及其在黑穗病菌胁迫下的表达分析
文献摘要：
从甘蔗栽培种R570基因组数据库中挖掘到60个ShWRKY(ShWRKY1～ShWRKY600)基因,分布于10条染色体上,每条染色体上有3～13个ShWRKY基因.系统进化树分析表明60个ShWRKY蛋白中,属于Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类的分别有10、32和18个.所有ShWRKY家族成员皆为亲水性核定位蛋白,且除ShWRKY13为稳定蛋白外,其余家族成员都不稳定.ShWRKY基因家族的外显子数目为1～5个,保守基序数目为3～7个.启动子区域序列预测显示,ShWRKY基因包含多个与胁迫、生长发育和激素响应相关的顺式作用元件.表达谱分析显示,ShWRKY基因在甘蔗不同组织中差异表达,且参与对黑穗病菌胁迫的响应过程.RT-qPCR检测结果显示,接种黑穗病菌7 d后,ShWRKY37基因在2个甘蔗抗病品种和1个感病品种中上调表达,而在另外1个感病品种中下调表达;ShWRKY51基因则在抗病品种中下调表达,而在感病品种应答早期(1 d)上调表达.
文献关键词：
甘蔗;WRKY转录因子;生物信息学分析;黑穗病菌胁迫;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
王东姣;张畅;阙蓓蓓;尤垂淮;罗俊;苏亚春
作者机构：
福建农林大学农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室;福建农林大学教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室;福建农林大学国际学院;福建农林大学生命科学学院,福建 福州350002
文献出处：
引用格式：
[1]王东姣;张畅;阙蓓蓓;尤垂淮;罗俊;苏亚春-.甘蔗栽培种WRKY基因家族鉴定及其在黑穗病菌胁迫下的表达分析)[J].福建农林大学学报（自然科学版）,2022(01):1-14
A类：
黑穗病菌胁迫,R570,ShWRKY,ShWRKY1,ShWRKY600,ShWRKY13,ShWRKY37,ShWRKY51
B类：
甘蔗栽培,栽培种,基因家族鉴定,表达分析,基因组数据,系统进化树分析,亲水性,核定,余家,外显子,保守基序,序数,启动子区域,序列预测,激素响应,顺式作用元件,表达谱分析,不同组织,差异表达,响应过程,qPCR,抗病品种,生物信息学分析
AB值：
0.184241
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