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2019-2020年辽宁省沿海城市甲型肝炎病毒基因特征分析
文献摘要：
目的 对2019-2020年辽宁省沿海城市甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)的基因特征进行分析.方法 选取2019-2020年辽宁省丹东、大连、盘锦市急性期甲型肝炎患者的血清或粪便标本(共162份),采用巢式PCR法进行HAV VP1/2A序列扩增,阳性样本进行基因测序,选取28个代表序列,同时从GenBank中下载全球HAV不同型别的基因序列,通过Neighbor-Joining方法构建亲缘关系进化树,分析基因序列同源性.结果 2019-2020年辽宁省沿海城市的162份甲型肝炎患者血清及粪便标本中,PCR阳性127份,均为ⅠA型;构建的亲缘关系进化树可分为2个进化分支,即分支1和分支2,与日本、韩国流行HAV的核苷酸同源性分别达98.8％～100％和98.4％～100％.结论 2019-2020年辽宁省沿海城市HAV基因型均为ⅠA型,与日本、韩国流行的HAV属同一分支.本研究为辽宁省甲型肝炎的防控提供了实验依据.
文献关键词：
甲型肝炎病毒;基因型;巢式PCR法;亲缘关系进化树
中图分类号：
作者姓名：
任丽萍;邵玉平;王艳;孙静;杨晓丽;刘杨;赵玲;韩一楠;于艳;方兴
作者机构：
辽宁省疾病预防控制中心,辽宁沈阳110005;丹东市疾病预防控制中心,辽宁丹东118000;大连市疾病预防控制中心,辽宁大连116000;盘锦市疾病预防控制中心,辽宁盘锦124000
文献出处：
引用格式：
[1]任丽萍;邵玉平;王艳;孙静;杨晓丽;刘杨;赵玲;韩一楠;于艳;方兴-.2019-2020年辽宁省沿海城市甲型肝炎病毒基因特征分析)[J].中国生物制品学杂志,2022(01):41-44
A类：
亲缘关系进化树
B类：
沿海城市,甲型肝炎病毒,病毒基因,基因特征分析,hepatitis,virus,HAV,丹东,盘锦市,急性期,肝炎患者,粪便标本,VP1,2A,阳性样本,基因测序,GenBank,下载,型别,基因序列,Neighbor,Joining,序列同源性,进化分支,基因型
AB值：
0.220851
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