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一起聚集性发热伴血小板减少综合征病原S基因分子进化分析
文献摘要:
目的 对2020年4月南京鼓楼医院送检的一起疑似聚集性发热伴血小板减少综合征(SFTS)开展病原检测,对其S基因进行测序,分析基因分型和系统发育特征.方法 采用荧光定量PCR法对6例疑似患者血清标本进行新型布尼亚病毒(SFTSV)核酸定性检测,RT-PCR扩增SFTSVS基因片段并测序.分析核苷酸同源性,构建系统进化树.结果 6例血清样本中,SFTSV核酸阳性5例.5例核苷酸高度同源,其中4例S片段基因核苷酸序列同源性100%,1例与其他4例间同源性为99.7%;最大相似株为江苏2014年分离株JS2014-06、2015年分离株JS2015-26,同源性100%.5例均聚集在C2亚型分支上.结论 聚集性疫情SFTSV基因型为C2型,与近年来国内分离株亲缘关系近.需加强监测和宣教,关注病毒的进化与变异.
文献关键词:
发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒;S基因;基因分型;遗传进化
中图分类号:
作者姓名:
何敏;董晓庆;石利民;王雅倩;张守刚
作者机构:
南京市疾病预防控制中心微生物检验科,南京 210003
文献出处:
引用格式:
[1]何敏;董晓庆;石利民;王雅倩;张守刚-.一起聚集性发热伴血小板减少综合征病原S基因分子进化分析)[J].中国人兽共患病学报,2022(06):502-506
A类:
SFTSVS,JS2014,JS2015
B类:
分子进化,进化分析,鼓楼,送检,起疑,病原检测,基因分型,系统发育,发育特征,疑似患者,血清标本,新型布尼亚病毒,定性检测,建系,系统进化树,血清样本,序列同源性,分离株,均聚,C2,聚集性疫情,基因型,亲缘关系,宣教,化与变,发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒,遗传进化
AB值:
0.256835
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