典型文献
四川省甘孜州藏猪戊型肝炎病毒分子流行病学调查
文献摘要:
为了解甘孜州藏猪戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况,分析其相似性和遗传进化关系.本试验用反转录套式聚合酶链反应(RT-nPCR)方法对采集于2018-2019年甘孜藏族自治州藏猪主要养殖区域4个县10个藏猪养殖场的229份藏猪粪便样本进行核酸检测,并对全部阳性样本进行ORF2基因部分片段扩增测序,遗传进化分析.结果显示:猪粪便HEV核酸阳性率为 16.59%(38/229,95%CI=12.00%~22.10%),猪场 HEV 阳性率为70%(7/10,95%CI=34.8%~93.3%);38个ORF2基因片段彼此之间核苷酸序列相似性为76.1%~100.0%,推导的氨基酸序列相似性为79.6%~100.0%,系统进化树分析显示所有阳性毒株均为基因4型,且与人源HEV毒株亲缘关系近.结果表明甘孜州藏猪中存在一定程度的HEV感染,与人源HEV毒株遗传关系近,相关部门采取防控措施以降低HEV感染的公共卫生风险.
文献关键词:
甘孜州;藏猪;戊型肝炎病毒;遗传进化分析
中图分类号:
作者姓名:
杨丹娇;张敏;何宗伟;杨珊;陈亭宇;王艳琼;叶忠明;汤承
作者机构:
甘孜藏族自治州畜牧业科学研究所,四川康定626000;四川省稻城县农牧农村和科技局,四川稻城627750;四川省乡城县农牧农村和科技局,四川乡城627850;西南民族大学畜牧兽医学院,四川成都610041
文献出处:
引用格式:
[1]杨丹娇;张敏;何宗伟;杨珊;陈亭宇;王艳琼;叶忠明;汤承-.四川省甘孜州藏猪戊型肝炎病毒分子流行病学调查)[J].中国兽医杂志,2022(02):6-11
A类:
B类:
甘孜州,藏猪,猪戊型肝炎病毒,分子流行病学,流行病学调查,HEV,感染情况,进化关系,聚合酶链反应,nPCR,甘孜藏族自治州,养殖区,猪养殖场,猪粪,粪便样本,核酸检测,阳性样本,ORF2,分片,遗传进化分析,猪场,彼此之间,氨基酸序列,系统进化树分析,毒株,亲缘关系,遗传关系,公共卫生风险
AB值:
0.261504
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