典型文献
奶牛与肉牛不同生长发育阶段肝脏转录组比较分析
文献摘要：
为探究奶牛与肉牛肝脏组织在不同生长发育阶段中的差异,利用RNA-seq技术和生物信息学的研究方法,分别对海福特肉牛与荷斯坦奶牛6、9和12月龄3个不同生长发育阶段的肝脏组织进行基因差异表达及表达趋势分析.结果表明:1)海福特肉牛与荷斯坦奶牛之间在6、9和12月龄分别获得的差异表达基因为699、486和769个;2)对海福特肉牛与荷斯坦奶牛之间的差异表达基因进行功能注释,发现细胞色素P450信号通路和PPAR信号通路中差异表达基因的表达量在肉牛与奶牛之间存在差异,并且在不同生长阶段表达也不同.其中与脂肪细胞增殖和脂质代谢有关的功能基因:ACOX1、APOA1和ACADM,与天然免疫相关的通路中BoLA-DQB、BLA-DQB和BoLA-DQA这3个基因在海福特肉牛中的表达均高于荷斯坦奶牛;3)STEM分析结果显示荷斯坦奶牛与海福特肉牛肝脏组织在生长发育阶段中具有相同表达趋势中,奶牛与肉牛的时序性表达基因与代谢途径相关信号通路上存在差异.综上,本研究表明与脂质代谢和脂肪生成等代谢过程有关的途径可能在协同调控奶牛与肉牛生长发育阶段中发挥的作用及表达模式存在差异,这为深入研究奶牛与肉牛在生长发育阶段中的比较提供了一定的基础数据.
文献关键词：
肝脏;奶牛;肉牛;短时序表达分析;生长发育
中图分类号：
作者姓名：
周乐;石彩霞;常晨城;王宇;满达;高静;张文广
作者机构：
内蒙古农业大学动物科学学院,呼和浩特010018;内蒙古自治区农业基因组大数据工程研究中心,呼和浩特010018;内蒙古农业大学兽医学院,呼和浩特010018;内蒙古农业大学计算机与信息工程学院,呼和浩特010018
文献出处：
引用格式：
[1]周乐;石彩霞;常晨城;王宇;满达;高静;张文广-.奶牛与肉牛不同生长发育阶段肝脏转录组比较分析)[J].中国农业大学学报,2022(12):158-169
A类：
BoLA,DQB,DQA,短时序表达分析
B类：
肉牛,发育阶段,肝脏转录组,牛肝,肝脏组织,seq,福特,荷斯坦奶牛,月龄,基因差异表达,差异表达基因,功能注释,细胞色素,P450,PPAR,生长阶段,脂肪细胞,脂质代谢,功能基因,ACOX1,APOA1,ACADM,天然免疫,免疫相关,BLA,STEM,时序性表达,代谢途径,脂肪生成,代谢过程,协同调控,表达模式
AB值：
0.255746
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