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典型文献
平菇生长发育过程中对IAA响应的转录组分析
文献摘要:
为了探究不同生长阶段平菇对IAA的响应机制,分别用高浓度(1×10-3moi/L)、低浓度(1×10-8mol/L)IAA处理平菇生长发育过程的菌丝体(7d、15 d)及子实体(25 d、27 d、31 d),以不处理为对照(CK),通过转录组筛选差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs).采用Venn分析、聚类分析、功能富集分析及共表达网络揭示平菇不同生长阶段对IAA响应的分子机制.结果表明,高浓度IAA处理菌丝体和子实体,分别筛选到DEGs 217个和10个,共表达关系对6 735个和32个;低浓度IAA处理菌丝体和子实体分别获得DEGs 81个和87个,共表达关系对766个和1 565个.GO及KEGG富集结果显示,低浓度IAA通过TRINITY_DN2732_c0_g1调控核糖体合成内源植物激素,通过TRINITY_DN530_c0_g1及TRINITY_DN3832_c0_g1促进子实体阶段的代谢进程;高浓度IAA通过TRINITY_DN41591_c0_g1调控甘 油磷脂 代 谢 过程,TRINITY_DN14069_c0_g1调控 几丁质 代谢及TRINITY_DN35150_c0_g1、TRINITY_DN5314_c0_g1、TRINITY_DN43009_c0_g1 调节氧化还原酶活性,同时通过TRINITY_DN21430_c0_g1 调控子实 体阶段 ATP 的 合成.以上结果表明,低浓度IAA通过DEGs影响平菇菌丝体阶段的激素合成及子实体阶段的代谢过程;高浓度IAA通过DEGs调控平菇菌丝体阶段的氧化应激机制及子实体阶段的ATP合成.
文献关键词:
平菇;IAA;菌丝体阶段;子实体阶段;转录组分析
作者姓名:
崔筱;张玉亭;孔维丽;胡素娟;刘芹;王彦坡;吴杰;师子文
作者机构:
河南省农业科学院植物营养与资源环境研究所,河南郑州450002;西峡县食用菌生产办公室,河南西峡474599
文献出处:
引用格式:
[1]崔筱;张玉亭;孔维丽;胡素娟;刘芹;王彦坡;吴杰;师子文-.平菇生长发育过程中对IAA响应的转录组分析)[J].河南农业科学,2022(12):97-109
A类:
3moi,TRINITY,DN2732,DN530,DN3832,子实体阶段,DN41591,DN14069,DN35150,DN5314,DN43009,DN21430,菌丝体阶段
B类:
平菇,IAA,转录组分析,生长阶段,响应机制,8mol,7d,差异表达基因,Differentially,expressed,genes,DEGs,Venn,功能富集分析,共表达网络,表达关系,集结,c0,g1,核糖体,植物激素,磷脂,几丁质,氧化还原酶,ATP,代谢过程
AB值:
0.134385
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