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多枝柽柳叶片响应NaCl胁迫的转录组分析
文献摘要：
在转录组层面解析盐生植物多枝柽柳响应盐胁迫的分子机制,为进一步挖掘耐盐关键基因提供参考.用200 mmol/L NaCl处理多枝柽柳0 h、48 h、168 h后,采集叶片进行转录组测序,分析差异表达基因(DEGs)并进行qRT-PCR验证.转录组测序原始数据拼接出Unigenes 105702个,同时在KEGG、KOG、NR和SwissProt 4大功能数据库中检索到注释的Unigenes为27670个.NaCl胁迫处理48 h后,多枝柽柳叶片中6374个基因的表达水平上调,5380个基因的表达水平下调;NaCl胁迫处理168 h后,叶片中有3837个基因的表达水平上调,7808个基因的表达水平下调.根据注释到KEGG通路中的DEGs,筛选获得8个表达差异极其显著的DEGs,主要编码WRKY和bZIP家族转录因子.此外,由KEGG通路分析可知,MAPK信号转导途径可能参与多枝柽柳生长发育及其对NaCl胁迫的应答反应.本研究通过测定和解析在高盐胁迫下多枝柽柳叶片转录组信息,揭示了盐胁迫激活MAPK信号转导途径以及WRKY、MYB和bZIP等转录因子参与耐盐调控过程,为进一步研究多枝柽柳耐盐分子机制奠定了基础.
文献关键词：
多枝柽柳;NaCl胁迫;转录组测序;转录因子;MAPK信号传导途径
中图分类号：
作者姓名：
陈亚辉;张师瑒;杨庆山;宋志忠;姜姜
作者机构：
南京林业大学林学院,江苏 南京 210037;不列颠哥伦比亚大学理学院,温哥华 V6T 1Z4;山东省林业科学研究院盐碱地造林试验站,山东 济南 250000;鲁东大学农林工程研究院,山东 烟台 264039
文献出处：
引用格式：
[1]陈亚辉;张师瑒;杨庆山;宋志忠;姜姜-.多枝柽柳叶片响应NaCl胁迫的转录组分析)[J].江苏农业学报,2022(05):1188-1202
A类：
B类：
多枝柽柳,NaCl,转录组分析,盐生植物,关键基因,转录组测序,差异表达基因,DEGs,qRT,原始数据,数据拼接,Unigenes,KOG,NR,SwissProt,胁迫处理,表达差异,WRKY,bZIP,通路分析,MAPK,信号转导途径,应答反应,高盐胁迫,叶片转录组,MYB,耐盐分子机制,信号传导,传导途径
AB值：
0.241226
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