典型文献
2018-2019年云南省部分地区鼠类携带汉坦病毒基因型别分析
文献摘要：
为了解云南省汉坦病毒的分子流行病学特征,本研究在云南省祥云县、泸西县、禄车县和楚雄市4个地区布点,采集鼠类动物标本,运用实时荧光RT-PCR检测鼠肺标本中的汉坦病毒中的汉滩病毒和首尔病毒核酸,通过PCR扩增S节段的全基因序列,并进行核苷酸同源性分析和遗传进化分析.结果 共捕获鼠类动物70份,包含10个鼠种,其中褐家鼠30只,占42.9％,其次是鼩鼱12只,占17.1％;核酸检测阳性标本19份,均为首尔病毒,检出率为27.1％,源自祥云县的标本检出率在四个地区中最高(32.0％).从鼠肺标本中扩增得到8条汉坦病毒S节段全基因序列,相似性为87.0％～99.7％,遗传进化分析显示基因序列聚集形成2个分支,一个分支属于S1亚型,另一个分支在遗传进化分析和blast比对分析中与其他亚型同源性均小于90％,属首尔病毒中独立的新的遗传进化分支,提示了云南省鼠类动物间多基因亚型首尔汉坦病毒流行,应进一步关注由宿主动物溢出感染人的潜力.
文献关键词：
汉坦病毒;首尔病毒;汉滩病毒;基因型
中图分类号：
作者姓名：
尚翠;杨丽芬;杜珊珊;Joseph O.Shaibu;周济华;黄晓霞;韩茜;李川;李阿茜;王芹;梁米芳;王世文;李德新;冯云;李建东
作者机构：
中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所卫生部医学病毒和病毒病重点实验室,北京102206;云南省地方病防治所,云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室,大理671000;Centre for Human Virology and Genomics,Nigerian Institute of Medical Research,Lagos 91000
文献出处：
引用格式：
[1]尚翠;杨丽芬;杜珊珊;Joseph O.Shaibu;周济华;黄晓霞;韩茜;李川;李阿茜;王芹;梁米芳;王世文;李德新;冯云;李建东-.2018-2019年云南省部分地区鼠类携带汉坦病毒基因型别分析)[J].病毒学报,2022(01):149-155
A类：
首尔病毒
B类：
汉坦病毒,病毒基因,基因型别,型别分析,分子流行病学,流行病学特征,祥云县,泸西县,楚雄市,布点,鼠类动物,动物标本,汉滩病毒,病毒核酸,节段,全基因序列,同源性分析,遗传进化分析,褐家鼠,鼩鼱,核酸检测,阳性标本,支属,S1,blast,比对分析,进化分支,多基因,基因亚型,宿主动物
AB值：
0.272517
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